EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-45313 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr8:9342985-9345141 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK2MA1103.1chr8:9344310-9344321ATGTAAACATG+6.14
Foxa2MA0047.2chr8:9344307-9344319CCAATGTAAACA-6.62
IKZF1MA1508.1chr8:9343621-9343633AAAACAGGAAAT+6.11
PAX6MA0069.1chr8:9345027-9345041AAGTGAAGCGTGAA-7.08
PRDM1MA0508.2chr8:9345023-9345033GTGAAAGTGA-6.02
RFX1MA0509.2chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT+7.25
RFX1MA0509.2chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT-7.25
RFX2MA0600.2chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT+7.53
RFX2MA0600.2chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT-7.53
RFX3MA0798.1chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT+7.18
RFX3MA0798.1chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT-7.18
RFX4MA0799.1chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT+7.56
RFX4MA0799.1chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT-7.56
RFX5MA0510.2chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT+7.6
RFX5MA0510.2chr8:9343686-9343702AGTTGCCATGGCAACT-7.6
SOX10MA0442.2chr8:9343973-9343984AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr8:9343973-9343983AAAACAAAGG-6.02
Sox6MA0515.1chr8:9344297-9344307CCATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
GGCAGAAAAT ATAGTATTTT GCAAAAAAAT GTGCAGCATT TAATTTAAAA AATGAAAGAG 60
CAATTGTTCA CCTGGTTTAA ATTTGTTTAA AATAGATTTG TTAAAAAATT GTGACTAAAT 120
TAAATCATAT TCTGAGATTA GAATCGTGAA TCATATCCAA TCGTAAGTCC AGTGAATCGT 180
TCCATCCCAA CTCCTAATAG ATAAAAATAA AGTCTGACAC AGATTGAAAA ACACTGAACT 240
GATTTTCAAT GTTAACAAAA TAATTATAAT ATTTATGATT TGTATTTACA TTTTTACAAA 300
TATAATAACC AATAAATATA CAATCAATCA ATGCAAACAA TACTTGCATT TCTATATACA 360
TGATTACAAT GTGTTTTCAG CATATACTGA CCGTTTTCAA TGGCAAATTC AACACAACAT 420
TAACTGAAAA AAAAACAGGG TTAAGATGAG TTCTGGGTGG TTGAAGAATT GTAGAAAAAT 480
AGATGGTGGA CAACTGGTGC CATATAATAG TATCACCTTA ATATTTACCC GACCTGTCCC 540
TTACCAATCA CAATTCTGAC TTTCCTATAA TCCCATCCAC TCCCATCCTA CGTCACACAA 600
TCGCCGGCTA AACGCCGTTT CCAAAGGGCT TTTGTGAAAA CAGGAAATCT GGCACAGGCC 660
ACGGGCCATG CTGGCAAGTT AGCGGGCCAC ACTCGGATGT GAGTTGCCAT GGCAACTGCC 720
GAGCCCGGCA CGATGGATCA GCACAGGCGC TTGCACCTAT AAACACACAC GCACGCATGC 780
AGACTGCAGA GTGTGGGTTT GTGCATCTAA TTTACCTGCA TGTGCAACAC CAAGGTGCAA 840
ATTGACACGG TCACATGACG GCTCCCTCCA GTTGTCCCAT TTCATCCTCC TTTTGTCTCC 900
CCCTTTCCTC CCTTTGATAA ACCAATTCGC ATTTCCCTCC TGTTTCGATG CAAATCACCG 960
CTGGAACGGC CAAAATGGGC TGGGATAAAA AACAAAGGAG GCGCTAACAA TGTGCGATTG 1020
TGCTGGCTGA CTGGGTTAAG TGATGTAAAG CGCTCGAATG AAAAGGAGTA GTGGTGAAGG 1080
GAAATAAATA AGTGGGTTCC TGTCCGCCGG GAAGAACCGA CACGTCTCCA CCCACTGCAT 1140
TGACTGCAAT GTGACTGAAG TGTAAATGAA CATGTATATA GAGAGAAGAG CAGACTCTGA 1200
GGCCAGGGTC TTGACGTGAT TGTGGTGTTT GACTGAATTG AATTCACTGA CCTGCGTTTA 1260
AAATCAGTGA ACTAGTAGGG GCTCACACAG AAGGTTCCAC TGCAGTCATT TCCCATTGTT 1320
TTCCAATGTA AACATGCACT GAATGGATGT GTTTTGACTG GAGTGTTTGT GTCCTTTGCA 1380
TAAACAGTTC AAGAAGTTTA TCTATTTGAA ACACAACTCT ATATTGTGTG CAACTAAGGC 1440
CAATAACTAG TAAGAGCTGT GCTGTGCTGT GTTGATTTAA AGAGGTGCAC TAGAGGTTTT 1500
AGCAATGTTT CTCACAGACT TGCACTCTAA AGGCCTGTTT TCACTGAGTG GTATGGTTCG 1560
GTACGCTTTT GTTTCCACTG TCAAAAGGTA CCAAAAAGCA AACCGTATTA CACCACTTTT 1620
TGGGTACCCT TTGCAAAGGG TACCTAGCAC GACAAAAATG TACAAAAAGG CGGAGCTAAA 1680
CACACAACTG AACGCTATTG GTTTACAGAG AAACTTCACT AGTGCATCCA CAAGCAGGAT 1740
AATAGTAATA CTATATAAAT ATAATAACAA GGCATTGTTA TATAATATAA TATAATAACA 1800
ACCTCACTAT TGTCTTGATG AACAGCCACA AAGTTATGAA AAACTAAATC TGCTGTGTCC 1860
TGTTTCTGTT TTAAAAGGCT GTCTAAAAGC GCAAGTGGTT TCACTTTCTC CAGAGAGCTC 1920
ACAATCTCTC GTGTGCGCAT CTATATTTGA AATAACTAAC TTTTTGAGCT GATGATAATA 1980
ACGTGCATGT GATTATTAAA AAGCTTCTGA CATTCGATCC CTTCTAAAAC TGACAAACGT 2040
GAAAGTGAAG CGTGAAAAAA AAAAGGAGAA GCCAAAAAAA CAAAAAACAA AACAAGAGCA 2100
AATGATTCTT TCAGCAACCT AAAACATGAA CAAACAGCCA TGTTTAACTA TTATCA 2156