EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-44288 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:54442828-54444624 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr7:54443586-54443597TAATTCAATCA+6.14
EOMESMA0800.1chr7:54444012-54444025CATTTCACACCTT-6.92
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr7:54443555-54443570TGACCTTTTAACCTC-7.99
RARAMA0729.1chr7:54443552-54443570AAGTGACCTTTTAACCTC-7.31
RarbMA0857.1chr7:54443555-54443571TGACCTTTTAACCTCT-7.37
RargMA0859.1chr7:54443554-54443570GTGACCTTTTAACCTC-7.11
SPIBMA0081.2chr7:54444298-54444310AATGCGGAAGTT+6.27
TBR1MA0802.1chr7:54444014-54444024TTTCACACCT-6.02
TBX21MA0690.1chr7:54444015-54444025TTCACACCTT-6.02
TBX2MA0688.1chr7:54444014-54444025TTTCACACCTT-6.62
Enhancer Sequence
ATAATTAAAA CTCAAGGCAT GAACATGTTT TATTTTGGTA AAATAAGTGA AATTTAGAAG 60
CCTTTTCCTT TTATATAAGC CCCTTCTGTT ACCAAATGAT CAACTAGAAG TCAATTTATT 120
ATTTGTTCCT AAAACCTGTA TAGACAACAA AACTTTTGTC AGTTAGTGTA GCTATTTACA 180
TGTGCATTTT GGAATATATA TATAATAAAA CGTATCTGGA TAGAAATGTC AAGAGGCACA 240
TCAAATCTTA CAACAATTTA TCTAGCATAC ATTTTACACA GCAGACGTTA TCCAGTACAC 300
ACACATCCAT ACACTATGCC AACTCAGTTC ATTCAGTTAA CCTATACCGC ATGTCTTTGG 360
ACTGTGAGGA AAATCAGAGC ACCCAAAGGA AACCCACACA AACATGGGGA GAACATGCAA 420
ACTTTACACA GAAATGCCAC ATGAACCAGC AACCTTCTTG CTGTGAGGTG ACAGTGTTAA 480
CCACTGAGCC ACAGTGTTGC CTCATTGTAC ACCATCTAAA ATATTATTTT AGTTATCCTA 540
AAATTCCTAC GCCAAAGTCT GTCAGCAAAA TTGTCTCCAG AGGTACCATT CAGAACTAGA 600
TGCTCTTTCC AAAAATCAAC TATCGACCAC CAAACGCAAG ATAGCATGAC AGCATTTGTA 660
CTTGTGTATC ATCAACAGGA TCTGAGGTGC AAGTAATTTA TTATCTGGGT AAAAAAAAGG 720
GAGAAAGTGA CCTTTTAACC TCTCCTAAAC ACAAACCATA ATTCAATCAC AAATTATTAA 780
TGTGATTCTT AACTTTGGAT GGAAACATAA CCACTCACAC CATGTCTGCA GTGTTTTCAA 840
TGTGTGCCGA CAACAGCGTG TGAACATACT CAGAGGTTGA GTCTTGATTG ATGGAAGCTT 900
CTAGAGAAGT TGTGGCATGC TGTACTGCTT GACGTTCTCA GGTTCGACCT TTGTCAAAAG 960
GGTTCCCGTG TACAAAGAGC AATGACTTCA GTGGGTTTTA TAGTCCGTTC TGACAGACAT 1020
TTACAGCGTT GAGCAGCACA GAGCAGCAGC AGTTAAAGCC ATCACAGTCC GAGTGAGGAC 1080
ACCCCCCCAC CTTCAACCTC CAACACAAAC GACGTCTCTG GCAGCAAGAA TGAAAAACAT 1140
TTGGGAGAGA AAACATGAAT GGGGTATAGG AGTCTCTCAC CATACATTTC ACACCTTTCC 1200
CCATTTGTTC TACCAGCATG AGAGATCATC CAGTGAGAGG AAAACTATGC TAAACCTTTT 1260
GCAATCAAAC GTGAGCCTGC AGCTCAACAA GTCTGGTCCA GTTTCATCTG GGCATTAGTT 1320
GGTGGTGCTG AGAGGAAAAC CACAGCGAGC TTAAAGTGGT ATTGAAGTCT ATTAGTCCGA 1380
TGTCAAAACA GCTGGAAACT AGGAAGTGGG TGTTTATTTA CTGATTGGCT TATGGACTAA 1440
AATTGATCCG TCTAGGATAA AAGAGTGATC AATGCGGAAG TTCTCTCATT CAAGTAAATG 1500
TATTGGCTAG ATCACCAACC ATTTTTTAAA ATTAGTTTAA CTTATATATT TCAGAATTAA 1560
ACATTTTATT TTATTGCAAT TATGAATTAG GACAAAGATG GAATTTTTGA ATTAGTGTAA 1620
GTTCCTTATT GTTTGCAAGT GTTTCAAATC TGAACAGGAA TAAACAAGAT ATTCTGAAGA 1680
ATGCTGAAAA AAACTATAGT ATTTTGATAG AATTTTTGAT CCTAGTATGG ATGCCGATGA 1740
CATTTTTTTT TGTACCAACA TTCTTCAGAA TATCTAGTTT TGTGTTCAAC AAAAAT 1796