EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-44253 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:53553044-53554116 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU2F2MA0507.1chr7:53553827-53553840TGCATTTGCATGT+6.37
RFX1MA0509.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.76
RFX1MA0509.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.77
RFX2MA0600.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.79
RFX2MA0600.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.92
RFX3MA0798.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.98
RFX3MA0798.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.99
RFX4MA0799.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.72
RFX4MA0799.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.88
RFX5MA0510.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.59
RFX5MA0510.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.85
SOX15MA1152.1chr7:53553164-53553174CTATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
TCTGTGAGAG AATTGCTCAG TGGCTTCAAC ATATTTCAAC AGAAGCCCAC TGACATCTCC 60
TGACCATTTG TTTTTCTGTG AAAAATGGCC TGCAAGTGTT TTCAAAAGCG TTTCGGGGGT 120
CTATTGTTTT GTTTTGAATG CAGTGTGTAC TAAAACAGTC TGGTTATTGG CAGTTTGAGA 180
GCTTTTCTGA AAATGGCTTT GTTTGTCAGT GGGGGCTGCC AACATTACCG CTACAGCCCA 240
CCTTAGCGAG AGTGTATCTG GCAGACTACC AAGCTCCGCC TACGAACGTT ACCCACCTGT 300
GTGAGCAAGG GGGGCGCAGC CTGTAGGTCA TGGCGCACGT CTTTGTTCAT TCATGCCTCA 360
AGGTTTTAAA ACCATTAAAA CTATGCACTC TAAATTTGGA AAATGCTGCA TGAGGTACTG 420
ATTTGTGCCC ATTTGGAGCT AAGCCCTGGG TCTGCCGGAG GCAGGAGGCG ATGGGGGATG 480
TAGTGTTAAG GGGTTAGGCA GAGGGGTCTC TCTGGGACCC AGCACGCTCA TTACTGCGAG 540
GAGTCCATCA CTGACAGCAG GTCACCATGG TAACGGTTGG TATGTGATTC CCACAACAAT 600
GCCAAACCTT CCCCCAACCT CCCTCACCAT TTTCCCCAAT CAGCACATGG AATTTTCTCT 660
CTCATTCTCT CTCTGTCCAT CTCTCCTCTC GCTGTCTTGC ACTATTACAG TATTGTTGGC 720
CAAGGACAGA GCGAAGGTGT TTTTGACAGC TTGTATAGTG GTGGTGGTGT TGGTATGACT 780
GCATGCATTT GCATGTATGG GTTGCATGGA AGTGTTCACT GCAAAACTAC AGGGCAGTAA 840
TTGTGTGTGT GTGCTAGATT GTTCCGGTAT AATTGTGTAA TGATGGATGG TGCTTCTCTG 900
GATTGAAGCC ACGCCTGCCC TCATAAGGGA GCGCTCTGGA GACGGTTGTA CGTTTGAAGA 960
TGAAGAGAGA TTGTGTTTAT GTGTGTTGGG GGTTGTAGAG GTATGGGTTT GATCTGCAAC 1020
AGGGTAAACA CTGGTTGGCC TGCTCTTGAC TGGCATTTTG TACTTTTTCC TG 1072