EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-43949 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:46395797-46396819 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr7:46396133-46396150TGATCTCTGCCTGACCT-6.07
RORBMA1150.1chr7:46396361-46396372AATTAGGTCAT+6.32
SIX2MA1119.1chr7:46396410-46396426GACTGAAACATGATAC+6.84
Enhancer Sequence
AATGTAAATG AGCCAAATTT TTAACATAAA ACTGTGTGAA AGAGGAGGGG AAAGCCAAAT 60
CTGTCTGTTC AGATATATTT AAATACAAAA TATGATGTGA CAGTGCACAC ACACACAAAG 120
CTGAGAATCT ATGCATTGTT CACACTATTA AGTGTTACCT CATTAATTTG CCTTTATTAA 180
GAATACATTA TGCACTTGTC TAATTTCTAT ACATAACCTC CACATAGAGA TTAATCAAAT 240
ACTGAATGTA ACCGAGGCAT TTCTCTCTGA GCCATTTACA CTGCTGGTGT TAAGGGTCAT 300
GCAAGTGCTG AAAGTGAACT GGAATGGGTT TGTCTGTGAT CTCTGCCTGA CCTTGTGGTT 360
TTGGTAAAGA GCGCTCTCTG GGATGCCTGT CATTAGAAGA CATGACTGCT TCTCTTTAGT 420
GAGCGGCGCT GTGGGCTGAA TGACAATAGA AAACTAATTC ACTGCTTCTC CCGCTGACTG 480
GGTGCATGTC TGGGTCATGC GGGACCGGGT GGAGACACAG TTCAGCACAG GGTCAAAGCC 540
TTTTTAATGC GTCATTTAAA TGTGAATTAG GTCATGGGGT TACACACGAG CAGCCTTTTA 600
GGTGTGATGT AATGACTGAA ACATGATACT GTGATTAGAC TGCAAAAAAA TGCCATTCTT 660
GAAAAAGCTA GAAACTCTGA AATTTAGTTA AAATGAGACA CTGCAGGCGG AGAAACCTTT 720
TTTTTCTTTC ATGCAGCTGT CAAACGTAGA GATTTTTGGC TTTTCATTAT ACTTTTCTCA 780
TTTTTCTTTT TTGCGTGTAA CGTAAAACAT ATTTCATTTC ATTCACTAAG TTGCATATTT 840
AAACATTTTT AAGAGCTTAA TAATATATGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 900
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TTGTGTGTGT 960
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGA TCCCTGCTTT TAAACACTTG TAGTATAAAT 1020
CA 1022