EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-43292 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:33407348-33409162 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr7:33408895-33408910TGACCTATTGACCTT-8.25
POU4F1MA0790.1chr7:33408262-33408276CATGAATAATTCAT-6.51
POU4F1MA0790.1chr7:33407661-33407675AATAAATTATTCAT-6.81
POU4F1MA0790.1chr7:33408263-33408277ATGAATAATTCATG+7.1
POU4F3MA0791.1chr7:33407659-33407675TGAATAAATTATTCAT-6.42
POU4F3MA0791.1chr7:33408260-33408276CCCATGAATAATTCAT-6.42
POU4F3MA0791.1chr7:33408263-33408279ATGAATAATTCATGCG+7.1
RARA(var.2)MA0730.1chr7:33408903-33408920TGACCTTTATATGGCCT-7.01
RARAMA0729.1chr7:33408892-33408910AACTGACCTATTGACCTT-7.75
Rarb(var.2)MA0858.1chr7:33408903-33408920TGACCTTTATATGGCCT-7.28
RarbMA0857.1chr7:33408895-33408911TGACCTATTGACCTTT-8.17
RargMA0859.1chr7:33408894-33408910CTGACCTATTGACCTT-7.46
SPICMA0687.1chr7:33407869-33407883AAAATGAGGAAGAA+6.42
TFAP2A(var.2)MA0810.1chr7:33408019-33408031TGCCCCAAGGCA+6.62
TFAP2BMA0811.1chr7:33408019-33408031TGCCCCAAGGCA+6.74
TFAP2CMA0524.2chr7:33408019-33408031TGCCCCAAGGCA+6.62
ZNF384MA1125.1chr7:33408330-33408342AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr7:33408331-33408343AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr7:33408337-33408349AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
TTTGGTCATT GATTCTTAGT TGTGAAAAAG CAGAACAGTG TATTACTTAT TGTTGCATGT 60
ATGTAATACT GTATCTGCGC AAAATGTAAT AAATATATTT GTCAAAAAAA GAATAGAACC 120
CAGTCACCAT TATTTTAGGA TTATTTTACT AGCCTGCCAT GATAATGTGG GTGCATTTTG 180
TCACCACTAG ACATCTCACT CACATGTACA CAAACACTTC TGAAGAGAGA CTGCAGTGTG 240
CTCAGAGTCA GTTTGCTTTG GCTCAGAATC AAATCGACCA TCATCACCTT GGCAAACAAT 300
TCCTGGAATC CTGAATAAAT TATTCATCTG AACAAGTTCC CTCCCCGCTG CCTGTCTCAA 360
CCCCCCTCCT CATTCTCTCT CACCCTCTAA GGCCACAGAC TGAGCTTCAC TTAATGAATC 420
TGGCTTAGTG TGTGTGTGCA CACAAAGAAC TGACCAAATA CAGCCCCACC AATAATCACA 480
CACACAGTTC TGCATTCATT CAGCGGCGAG TACTTCAGGA CAAAATGAGG AAGAAAATGA 540
AGACAGAGGG AACTGTGTTA AACACAGAGG GACAGCAGAT CAGGGGCCTC TGTGGCTCAG 600
TAATTAAAGG GCCACATTGA CAAGCACAGC CGTCCACTTC CTGCCCTAAC GCAGTCACTC 660
CTCCCCCCTT CTGCCCCAAG GCACTAACGT ACCACAAGAT TAGCACCATT ACAAACTCTC 720
AACGGTGTTT ACATAAAACA CTAAATTAAT AGTATTCTGA ATGCGGCGGA TCCTGAAAGC 780
ACATGACAAA TCTGGCACCT AGATGCATTT TCCTCCCTTT CCTTTCCAGT CAAAAGCACT 840
ACATGAAGGG CAGACTATGT GTTATCAGAC TGCTGTCATC ACTAACTCCA GAGAGAGCAG 900
GGAGTCCATG CTCCCATGAA TAATTCATGC GTTTGAGTCC ACTCAGTCAG AGCTCTATTG 960
ATAAACAAAA GAGAGGCTCT GCAAAAAAAA AAAAAAAAAA AGCCAGTCGA TTAACCTGTT 1020
TGCGCAAAGC CCCTGCACCT ACTCTTCCCT CCCTTTTCAT TTTCTCTCCG TCTCTCTCAC 1080
AGCTGGAGAT AAGTGCCTGA CAGAAGCTTT CAGAAAATGC AGTGTCTGTG AGAGAGAGAC 1140
ATGTGGCCCA GACACACACA CACACACAAC ACACATATAT TCGGAGTAGC TGATGGATCG 1200
TGCATGCTGT TCCAATTCAC CACCCTCACA CTGATACCAT TAACCTTGTG AGGCCTCAGG 1260
GTGAGAACCA TAAAGGGCCT CTTCAAACTG AGCCCTCCTC ATATGACTAT ACATCATATC 1320
ACTGCTAATG ACATAGAGAA AAAGAGAAAT AGAGAAAAAG GGAGGTGCTG GCTGGTCTAT 1380
CTGTTAAAGT GCACCAATTG CATAACCTTA CTTTGTTATA AGAACCAATC GACTGATTAA 1440
AACACACACA ACAGCAACAT GAAGGCTGAC AACAATTAGG GTAGGGATGC CAACCATTAG 1500
CATCAATTAG TAAAAGAGGT TAAATAACAC TTCCCGCTGG ACACAACTGA CCTATTGACC 1560
TTTATATGGC CTGGCATCTG TCCTTGCCTC CATCCTTCTC TTGCTTTTTC CGTTTATTTT 1620
TAGGTCTGTT GCGTGCAGAC ATCGCTTTTT ATTATGGTTA TTTATAGATG CAGCCCAGAA 1680
GAGGGAAAAG ATTCAGGAAA TGGACTCAAA CTTGCACAAG CCGGATTCAA ACACGTGCAC 1740
TAGGGCTGTG TGATTTGGGG GAAATATCTA ATTGCGACAG ATATTGCGAT TTGATTTGAT 1800
TTGCGATATA AATT 1814