EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-42874 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:24301831-24303095 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr7:24302956-24302973ATAAATTAATTAATTTA+6.07
ArxMA0874.1chr7:24302957-24302974TAAATTAATTAATTTAT-6.07
CTCFMA0139.1chr7:24302000-24302019CTGTGCCATCTGGTGGAGG-6.3
DBPMA0639.1chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA-6.32
DBPMA0639.1chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA+7.22
ETS2MA1484.1chr7:24302555-24302565GACCGGAAGT+6.02
HLFMA0043.2chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA+6.27
Lhx3MA0135.1chr7:24302616-24302629TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr7:24302958-24302971AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr7:24302617-24302630AATTAATTAATTT-6.92
Lhx3MA0135.1chr7:24302959-24302972AATTAATTAATTT-6.92
POU4F2MA0683.1chr7:24302074-24302090ATGAATAATTAAATAG+6.54
POU4F3MA0791.1chr7:24302074-24302090ATGAATAATTAAATAG+6.27
POU6F1MA0628.1chr7:24302618-24302628ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr7:24302960-24302970ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr7:24302618-24302628ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr7:24302960-24302970ATTAATTAAT-6.02
SPI1MA0080.4chr7:24302317-24302331AAAATGCGGAAGTG+6.84
SPIBMA0081.2chr7:24302319-24302331AATGCGGAAGTG+7.22
TEFMA0843.1chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA-6.04
TEFMA0843.1chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA+7.22
Enhancer Sequence
TGATTTCCCA GTATTTCTCT TTTCCAATCA GGAGATCACA GTATTACTAT GGTACAAATA 60
CAACATACAA AAGAAAGAGA ATGACTTAAA GTCACACATC TGTTTAATAA TGATTTGATT 120
ACCTGTAGTC TGAAATCACA CTGTATTTTT CATAGGGCTT ATGCGGTCTC TGTGCCATCT 180
GGTGGAGGCA CATCGTCAAC CGTCTTTGCT TAAAGGCAGG CTAATGGCCG ACGTCTCTCA 240
GAAATGAATA ATTAAATAGG AATGCATTCG TTTAGATTGC AACTATGCAG TTTATTTATA 300
AGGATAGTGC CTGACTAAAT TAAGCCTCAA AAGTACATTG TGTTGTACAA CAACAGCAAT 360
ATTTGCCAAA GTGTTCTGCC AAAGTGTGCC AGAGTGTTCT GCTTGTCGCT GTTATGTAGG 420
CGGAGTAATA CACGAGGGTG AAGAGGCTGG TCAAGTGCTG TTACCGGCAA ATACTGACCT 480
TATTTTAAAA TGCGGAAGTG CGCCTGTTTT CGTGATTGTC TTAGAACTTC CGTTTCAGTC 540
GCCAACGGGA GAAATGACTA GGAATAATAA ACGGCAAAAA ACGGTCAAAC TAGTTGCTCT 600
ACAAACAAAT GTTTGCATGA CTATACAGAC CAAGTAGAAT AATATAACAA GGAAATATCA 660
GTTTGCAACA TCAAACAGCG AAACGAGCAG TTTTTAATGT CTAAAAATGA ATGGAAGTGA 720
ATGTGACCGG AAGTCTCGTG CCAAAAAGAT TCAAATGGCA GCGCCCGCTC GTCACATATA 780
TATTATAATT AATTAATTTT TTTAGCTTCT AAATGAATGT TTGTGCCCTT TCCACTAGAT 840
GTTGCCTTTG TTCTCTCCTC TTTCTTCTGA GAGCGCTTCA GTCCCTGTGT GGTTTTGTGG 900
CATAAGTTGT GCTGTGACAT CTGTCCTGCT CTCACTGTTT CTGCTCACCC ACTGAAAGTA 960
TCAGCTAATG AGATCTCTCC ATTCTTCTGG TGGAAGGTAA TGCTTTTATC TGGGTATTTC 1020
AACATAGATC TGTAATATTT ATTACGTAAC ATAACACAAA CAACTTCTCA GGGAGTGTGG 1080
ATGGCTATTA TCGGCTATGG AATTTTGAAA AAAATGCAGC TGTTTATAAA TTAATTAATT 1140
TATGTATTTT TTATGAATCA GTGTGCTGTT TTGGGGATGC ATGTCACTCT CCTAGATGTT 1200
TTTTCTTTTC TGTTGATGTT GAATCTGGGT GAGTTTATTT GCTGTTTTCT TAACTTTTTA 1260
ACTG 1264