EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-42365 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:9725825-9727058 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr7:9727032-9727042GACAGCTGTT-6.02
FOXD2MA0847.2chr7:9726939-9726952ATGTTTATTTAAG-6.14
FOXE1MA1487.1chr7:9726938-9726953AATGTTTATTTAAGA-6.58
RFX3MA0798.1chr7:9726801-9726817GGTTACCATGGTAATT-6.16
RFX4MA0799.1chr7:9726801-9726817GGTTACCATGGTAATT-6.18
RFX5MA0510.2chr7:9726801-9726817GGTTACCATGGTAATT+6.08
RFX5MA0510.2chr7:9726801-9726817GGTTACCATGGTAATT-6.15
Enhancer Sequence
AAAAAAGTCG CATCTTTGAT AGCCTGAGTA ACAGCGTTTC ACTTTTTTTT GGTGAACTGT 60
CCCTTTAAGG TTGCTGTGAC TATAGTTGTT TATGTAGTTA TTTACAAGAA TTTAAATGTT 120
GTTGTTTTTT AATGGTGTTG TGAGCTTGGC AGGTATCAAC TTACGTTACA CATCAGTTTG 180
GCAACGTATA AATCCAAGCA AAGACAAGAA CATTTGCTTA AACTGGTCTT AAGATGTTTT 240
TCTAAGCAAA ACATGCACTT AAACTGACTG ATTAAACATA GTTTGTTGCT GTTTTTGCAT 300
TCATACATAT TATTAATGCC TAACAAAACG ATCTAATAAC CGTCAATGTA CCTGACTGAC 360
TCTCTGTTCC AGCTTCTGAC CGTGTCTGTG TGTGTCGATT TGCTTTCTCT TAATAAATCT 420
GGGACCGCGT GCACGGTTCT GTCCCTCTTT TCTGACTGAC AGCACCATCA GCCAATGAAG 480
CTGCAGCGGT ATATTTATTT AGATCTCATC GACCAATCCG AACACAGAAG GGGCGGAGCG 540
TGTGTGTCTG GAGGCGGGGT TTCTGCCTGA AGTTGTGTTC CCAGTCTACT GTAATTAAAC 600
TTTCTGAAAC TTCGCGTCAG TCCGCTGTTG CTGCTCCGCC AGCACACGTT GTCAGTCTTC 660
TCCACACTGC AGACTGGTTT CTAAGATATA TCACTAATAA TAATAACAAC AATAATAACA 720
ATGTACGGTA ATGACACTCT GCTGCTTTTC CTGACTTATC TTCTCTTTTG CATTGGATTG 780
AAGGCAACAT CAGGTAAGAC ATCAGCACCT GCGATACTCC TGACAGAAAT TCACCATGGT 840
AACCAGTTTT AGGCTATCCT GCTAATGTTA AGACGTGTAC TACATAAAGT GAAAATGAAT 900
TAAACAATAG AAATAAAATG AAAACGTGCA GACATCTCCT GAATATGTCT TTAGTGTCTA 960
TAGCAGCGGA AACGTTGGTT ACCATGGTAA TTTATTTGTC CGGATCATTT ACTGCATATT 1020
CTACTAGCAC TGACTTGTTG ATGCCGTTTT AACTGCACAT TTTCCTGCTG CTTGCAAACG 1080
AAGTTTCAGC CATGCTGTTT CAATTAAGAT GAAAATGTTT ATTTAAGAGC CATATATAGG 1140
GATTGCCACC CAGGGTTCGT TTCAAGGAGG TTGGCTGTGT GTCAAAACCT AGTGAGCTGC 1200
CTACCTAGAC AGCTGTTTTG GGCTGCAGAG GCG 1233