EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-42270 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:7322838-7324246 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr7:7324078-7324091AAATCCACTTAAA+6.39
SCRT1MA0743.1chr7:7322951-7322966CTTCAACAGGTGTTT+6.22
SCRT1MA0743.1chr7:7323705-7323720CTTCAACAGGTGTTT+6.22
Enhancer Sequence
GTAAGCTAGA TTAAACAGCA GAGTAAAACT GTATACTTTA CATCTGCACA GTACTGAGCT 60
GCATCATACT CTGCTTTTTC ACACTGTTCT TGATTTTATT TTAAGGCAGA TGTCTTCAAC 120
AGGTGTTTAA GTGTGACTAC ATTGACTGCT ATAAGAGTTG ACGAGTTAAC AAGTGTTGGA 180
GAGCAGGCGC CACCCCTCCC CCACTGCTCT GCTCTGCTCT GCTCTGCTCT GCTGGGGGAT 240
GGGGGAGGGG CGCTGCTGCT GATCACACAC ACACACAGCA GACTCTACAC CTGTAAGCTG 300
AGCTGGCCTT CATCAGCTCA CAGTCACTGT GTGTATTTAA AACATCATAT ATTCATACAT 360
ATTTATAAAT ATTAAGCCAC TGATTATCAA GAAGTGGGGA AAAAATAGGA CACAATGTTA 420
AAATAAATTG ATCTACATTT TTATATGTCC TAAACTATGA TAAAACCTCC CAACTTCTCA 480
TTTTTGATCA AAGCATGTTT TTAACTTTGC AGACATTATT GCAGCATCAT CAGACAGTCA 540
CTAAACTGCT ATCAGGAGGA TTTAACTAAT CACATTCTCA TGTTAGACAT CATATTTTCA 600
CATGAACAAC AATTCATCAA CCACTGTAAA ATATCAATGA AATATTTCAA AATCTACATC 660
TGAATGAGCT GAGGAAAATC TGCATTTAGT CATTTTAGCT ATCCAATGCA CTGAATCTAT 720
GAGCAGTTAT AATAATTAGG ACACATGTTT GTTGTCATCA CTTTGTAAAG CAGATTAAGA 780
CTGTTTGCTT TAGGTCTGCA CAGTACTGAG CTGCATCATA CTTTACACTT TCCCACACTG 840
TCCTTGATTT TATTTTAAGG CAGATGTCTT CAACAGGTGT TTAAGTTTGA CTACATTGAC 900
TGCTATAAGA GTTAACGAGT TAACAAGTGT TGGAGAGCAG GCGCCACCCC TCCCCCACTG 960
CTCTGCTCTG CTCTGCTCTG CTCTGCTGGG GGATGGGGGA GGGGCGCTGC TGCTGATCAC 1020
ACACACAGCA GACTCTACAC CTGTAAGCTG AGCTGGCCTT CATCAGCTCA CAGTCACTGT 1080
GTGTATTTAA GACATCATAT ATTCTTACAT ATTTATAAAT ATTAAAACAC TTTCCCACAC 1140
AGCCCTGGCT TTATCTAATG GGCATTGTCT TAAACAGTTC TTGATATCCT GTAGCTGTTT 1200
AAAAGATTAC TAAACTTCTC TTACTTTACA TGAATCAGAC AAATCCACTT AAAATCATTA 1260
TGACCACATC ACAGAACATT TCTCTGCTGG TATAATGCAT CATACTCTTA AAGGCTTTGA 1320
CCACAATTAG GCAAGTATTA TAATGCATTG TAAGTTGTGA ATATTTATCA GCTCAGATGC 1380
ATTGTTAAAT TATAAAGAGG CAAACAGA 1408