EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-42252 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:6885623-6886433 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr7:6886340-6886352ATGTAAACAGAA+6.92
FOXP2MA0593.1chr7:6886340-6886351ATGTAAACAGA+6.02
Lhx3MA0135.1chr7:6886415-6886428AGATTAATTAATC+6.03
POU6F1MA0628.1chr7:6886417-6886427ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr7:6886417-6886427ATTAATTAAT-6.02
PRDM1MA0508.2chr7:6885991-6886001TCACTTTCAC+6.02
RFX1MA0509.2chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC+6.07
RFX1MA0509.2chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC-6.09
RFX2MA0600.2chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC-6.56
RFX2MA0600.2chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC+6.57
RFX3MA0798.1chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC-6.25
RFX3MA0798.1chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC-6.07
RFX4MA0799.1chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC+6.39
RFX5MA0510.2chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC-6.57
RFX5MA0510.2chr7:6886315-6886331AGTTGCTATGGAAACC+6.63
Enhancer Sequence
CATGCAAAAA GGTTAATTTC GAGCCCTGCA ATATCATGTA TTTTAGTACA TTAAGTTAAT 60
TTAATATGAC AGATGTTTTG TTTCCAGCTA GCTAAATAAA TATAAATTTA GCTGTATAAC 120
TTTAAGTTTA ATGAAAGTTC TTTATATTAT GAGCAGTTTA TAGTTTGGTT ATAATATGAT 180
GCTGTTTTTA GTGTTGCTGT TCCTTAAGTG TCCACATGAA CTCAAGAGTT GCTGAGACTT 240
TCATTTTAGG ATGTTGATGT ACTTCCAGGG CTTAATTTGT GCCGGAACAT GATGGATCTG 300
GATCCACCAC CTCAGAAATC TGATCTGGCA CCTAATTTTA CCGATCCCCC TCCTCACTCG 360
CCCGCTGTTC ACTTTCACTT TGTTCCGTGA CTCCCCAAGC CTCTTTACTT TTGTTCACGA 420
CAACCAACCC CCGCCCCTGC TCTTAACTTG CATCTGCGAC GTCCCTACGC TATCCAACAC 480
CCCGCTATGA CCTACACCCC CCAACCCCCA CTCTCCACTT TCGTGCACGA CACCTCTACA 540
TCCTCAGGTA GCATGCTGGA TCTGTTACTC TGATCTGTTC CGGCACCCCT CTACTCAAAT 600
GAATATTGAG TAGGAGGCGG GGCTTTATTT TGTGCATCGT TGCCTCATAA CAAACTAATA 660
ATAAGAGGGG TGGGGCTAAA ATATTGATAT AGAGTTGCTA TGGAAACCCT CAGGTTGATG 720
TAAACAGAAA GACCACCACT CCAAACGAGG AAGCAAATGG TCAGACTTTG ATTGAAGATT 780
ACTAAAACAA ACAGATTAAT TAATCATAAG 810