EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-42166 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:5251689-5252995 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr7:5252144-5252161AAAAGATAAACAAAACG+6.2
Gfi1bMA0483.1chr7:5251692-5251703AGCTGTGATTT-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr7:5252443-5252456TAAAACACTTAAA+6.33
Enhancer Sequence
GGCAGCTGTG ATTTATGAAC TAACACACAC ACACCGGTCC CAGGTGTGTA TTCTGCCTCA 60
TATACAGTTA CCCATTATTC CAGGTCTCAT CTGACCTATT TAAACAAAAA CACAGTTGAA 120
CAAACACTCG AGCTCAAGTG TCATTACAGC CTCTAATGAA GCCCCGGACT GTCCACTGCA 180
CTGCAGCTTC GCTTATGAAG AATGAGAAGT CTACTGTAAC AGACCAAATA TTTTATAAAT 240
GAGCGTCCAT TGAGTGTTTC AATGCTGTGC TCGGGTTACA GTCTCCTAGG AGACGGCGCT 300
GAGGACATCT GAGCTCATCA CAACGCGCGG GCCTCAAAGC CTCGGACTGG CGGAGCCAAC 360
CACCGCCGTG GGAGACGCGT ATAAACTCAG CTAAGCGAAA CTACGAGAGT TCGAGGCTTC 420
AAGGCCTTCC TCCAAATGCA CTCGACGCGA TACAGAAAAG ATAAACAAAA CGCAAACTAA 480
TAATATTAAT ACCACGAGTG TTATTACAGT TCGTGTTTTG GCTACATTTT TCATGCGAGT 540
AAAAGGTTTT TATAACTAAA AGCGAAATAA AATAAACCAT AGCGAGCATT TCCTATTGAG 600
GGTTTATTCC GATTTAGAGA ATAGAATGCA AATATAACTT ACATCACTTT TATAACGTGC 660
ATGCAATTAA AAAAAGTACA GGCTCGTTTT AAAATTACGT AGTTATGAGG TAAATTACCA 720
AACTTAGTTG CAAAAAGTGT AAACTTCAGT TTTGTAAAAC ACTTAAATAA AAGGCAGTAA 780
AAAAGCTGCA TTTGTGTGTT GTAGAAATAT TCAACATGTT TTAAATTACA GGAATTTTCT 840
ATCAATCATC ATCAAATACC TGCATCCAGT GAACAAGTAG CACTAACGAT GCCCGAGTAT 900
CTAACGAATC GTTTTATTGA ACCGAATCCT TTCAACCATT CAGAACAACC GACTCACTCA 960
ACATTCGTAA GACTGCAAAA CGGCAGCATT AAAACACATG AAAGTACATA ATTACTAACA 1020
ATACGTAAAC TTAAATAAAA CAAAATGTAA ACATAACGCT GCAATGAGGA ATTTCAAACG 1080
ACGATTCAAA AGGTAGCGAT CAATGAAACG AACCGACTCA CTAAACTGAA TCACACACAA 1140
ACTAAAGATC ACTAAAGCAA GACGGAAACA AATAAAACAA GTCTGCTTGA TTTTAAACTA 1200
ATAATTCTGC TTACAAAACC ACTCCAAAAA AGCACACAAA GTCTAATAAC CATCCGTACC 1260
TCTTTGTCCA GACGGCTGTT TAGTGGATCT GAACACAAAG AAGAGT 1306