EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-42136 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr7:3657902-3659060 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr7:3659044-3659058TATTTAAATATTAG-6.04
RARA(var.2)MA0730.1chr7:3658260-3658277TGACCCTTATGTTACCT-6.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr7:3658260-3658277TGACCCTTATGTTACCT-6.26
ZIC1MA0696.1chr7:3658202-3658216AACAGCAGGGGGTA-6.24
Enhancer Sequence
TATTATTAAA ATGTTATGAA TTGCTTCCAA ACACATCTAC AACTAGCCCA AACGGTTGAT 60
CACACGACAA ATAAGTCATA AATAGAAGGA GAAAATAATA ATTCAATGTT TACCTGCTCT 120
TGTCTATTGT AAGGATCCAA AATATCAGAC CATAAGAACT GTTATGGAAT TTCATGAGAC 180
AAGATGCAAT GTTCCAATAG ATTTTCTAAT CTGAGAAGTG ATGAAGAAAC CAACTGTTCC 240
ACTGTTCTAT TCAAATTACT GTTGACAATG CAATCACAGG CTGGAGAAAC AGAGCTACTC 300
AACAGCAGGG GGTAATGCGA AGAAGTCACC CTTCTCCTTC CACCTAAACC CCCCTTCTTG 360
ACCCTTATGT TACCTTCTGA TTAGAGCACA TTTCACATAA AATGTTCAAG GTTTTAATAT 420
GGTGTATCTT GCATCACTAT ATTCATGTTT GGTATCATTT TAAATGTCTC TGTGTGATTG 480
GTAAAGTGGT CTTAATTTTA CAGTAATATT TTACTGGTAT ATGTTGATTT GGTTTTTGAC 540
TTCTATAAGA TCTTGATAAG ATGCTCTCCC TCCTAAGAGA TGGTTAAGTC CTCAAATTGA 600
CCAGGTCAGG GTTTCTGTGA CACTTCTATT GTCTTGAATT TATGGCTGTT TGTTTTGACT 660
TGAGTATATA AGGTAAGATG TGCTTTAGGA CAGGGGGAGA TCTTGTAAAA AGACACCCCA 720
TTGCAGCATC TCTGAGACTT ATGCTGCAAT GTATTTCTGT GGTCAGGTAT GCATCTCTTA 780
ACTCTTTGAT TTATCTTTGA TTAATGGATG TTATATTGTT AGTCTCATCT CTGAATTGGC 840
TTCCTGATGA TTTATTATGT AATTGGCAGA ATACAATTTT ACCTGACAAA TAAAATTTTA 900
AGTTTTGATT AATTCTGGAG TTTTGCGAAT TCATTGTATC CAGTAGATTA TGTGGAGTCT 960
CGTTACCCTT ATCGTACGGC ATAATCGAAA TTGATTTAAT TGGCGCATTT GATTATTCGT 1020
AGCCATTGCG TGCCGATAAC ATGTAGACCT TTTAATCATT CGACCACTGG GAATAGCAAG 1080
TTGTATGGGC TTGGCTAAGG ATCTGTTTTT TTAAGACTAG GTAAGCGTTA ATGCGACCAG 1140
CTTATTTAAA TATTAGTT 1158