EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41859 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:55744343-55745583 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr6:55744881-55744902GTTAGGTTTCAGTTTCCTTTT+7.3
IRF2MA0051.1chr6:55744880-55744898GGTTAGGTTTCAGTTTCC-6.28
IRF3MA1418.1chr6:55744884-55744905AGGTTTCAGTTTCCTTTTTTC-8.03
IRF9MA0653.1chr6:55744885-55744900GGTTTCAGTTTCCTT-6.66
LMX1BMA0703.2chr6:55745054-55745065GTTTTAATTAA+6.14
PAX6MA0069.1chr6:55744706-55744720TTCACGGTTGATTT+6
POU3F3MA0788.1chr6:55744521-55744534AAATTAACATATT-6.41
Enhancer Sequence
AGTATTTTCA AATATTATAC TGAATTATCG CTTGTTAAAG CACAATCAAC AGTACAGTTT 60
ATTACTGAAC TTAAATATTT AGTTTTAAGA CATAAATGAA ATGCGATTCA TTTTGCTACT 120
GCAGCAATCA GCTTATGTGC ACGTGATCTG CTCATGCATG CATATGAATC ACGGAGGAAA 180
ATTAACATAT TAACACCAGT CAGATAGCAC TCAAATGATG ATTAAAATAA CCAAAACTAT 240
ACATTTCTGC TTCATAACAT CTTCTAGTTT GCAAATAACT ATTTGTATCT TGAAATAATT 300
AAGCAGCGGG CAGATAAGCA CTGTAGGAGC AACTTTTTCC TCTGTGCCGA AATTGAACTC 360
AGATTCACGG TTGATTTACC CTCAAATACT GACATGACAG TCACGATTTT CATGCAATAA 420
CCAAAGTAAA GTTCTCACCG GCTGCCACTC CGGGACTTGA TGATGGTTTT TTAACTGTTG 480
TGCACTTTCT TTTGCTCAAT TTTGGCGGAG ATTCAGCTTT GGCGGAGATT CTGTTCAGGT 540
TAGGTTTCAG TTTCCTTTTT TCCTTACGTG AATGCCGAAC TACTGCATGT CCTTCCGCCT 600
CTCCCTCCAA CTGGCGGATG GATTTTTTTT TCTCCTTCTA TATTAGTTTG ACTTGACATG 660
CATATTGTAT CTAATCGCAT TATTATAATC AAAAATCTGA TTGTACTTAT TGTTTTAATT 720
AAATGTTTTA TCATATATGA AATTGCAACT TATTTGTGCA TGGTGAATCC TGAAGTAACT 780
GCTTTATATG TGTCTGTAAT GTATCATACC GTTGGCTAAG CATCATAACA TATTGGTTTC 840
TGAAATGGAC ATCAAAAGTA CAAACTGAAG CTCACCTAAA CTTTGGGTTA ACAATGCAAG 900
AATTGAATTC TCTCAACATT AAGTTTAATG ACTGAGGTAA ATCAAACACC TAATATCATA 960
CCAAAGCTAC AGAACTGGAA AAAGCAGTGG GAATTACAAG TTGAATTGTT CTTTTCCTGA 1020
CAAACAATTC ACAGGTTTTC TGATGGTTAG AATTGAAGCA GTAACTTCGA ACCCCTGGCC 1080
TGCTTAGCAT ATTTGTGTTT TCATTTGCAG CCTTAATTAG CATGAAGTGA ATTAGCAGCT 1140
TATTCATTTC AAAGGTTCTG GCAACCCAGC AGTTCACAGA GACTATACAT GGCTTGTAAA 1200
TCTATGCCGG CTTTGTTCTT GAACTGTATA TGCTTCACGC 1240