EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41849 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:55250445-55251429 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr6:55251264-55251279TTTTAATAATTAATT-6.31
Lhx3MA0135.1chr6:55251267-55251280TAATAATTAATTA-6.18
POU4F3MA0791.1chr6:55251265-55251281TTTAATAATTAATTAC+6.19
RFX5MA0510.2chr6:55250862-55250878TGTTGCCACAGCAACC+6.28
RFX5MA0510.2chr6:55250862-55250878TGTTGCCACAGCAACC-6.28
Enhancer Sequence
AGAAAATGAA TTAATGAATA AAATTGTAGA AACGAACTTG TTTTGGCAGA TAACATCCAT 60
TTGTACCAGT TTTTCTACAA AACCATAATA AACAAACTAG GGTAGCGTCT ACCACACAAA 120
TTAACCATGG TTTTGCGACA CCAACCATAG TTTTACCATG GTAAATGTTG TAAAACTATG 180
GTTATACAAA TGAAAAGCAC CAATAAACTG CAGTTTTACG ATCAAAACCC TGGGGTAATT 240
TTCATAAAGG CGTCGTTAAT TTTAAACTGT CCGTCACAGT AGTTGTTCAC ATGCGTCTGG 300
TAAGAGCTAG CTAGTTATTT AGCAAGCTAG TTAGTCAGTA AATCACTCAG ATAGTTAGCT 360
TGCTAGTTAG TTAGCTAGTT AGTTGAGTGG ACACCGGTCG GAGCTCGCGC TGGCTCCTGT 420
TGCCACAGCA ACCACTGAGG AGAAATCAGT GCAGCTTCAG ATGCTGTAGC ATTACCGCAA 480
TGAGGGGGAT GTAGCAGTTG TGGTCGGACA GATGGGACCT CAAGATTGAC TGTGACTCAC 540
CACAAAGCGA CGAGAAAAGC AAAATGTGTC CGTAATAGAC GATTGTTTCA TTGGACTGGA 600
GGGTCGAAGC TGGACGCGAC CGTTTTCGAG CCACATTCAA GACCTCAGGG TGAGTGTCAC 660
TGGCGAAAAC TGCGGATTAG CATGATGTAT AACGAGAGTT TGGCCATTCA ATTATTAATT 720
TGCATCAAAT GTTGATGTGT GTTTGAACAT CTGATGAACG TCTACGGCAA CGCGACTTTT 780
TCTCTCCTTC CAAAGGCGAA TATATGCGTG TCAGATTTGT TTTAATAATT AATTACATTT 840
ATCCGAGCCG TCATTTAAAT ATTAAAACGA CGTATGAGTT AGGAAAGCGA CAGCTAGATC 900
TAAAATCCTC AATGACAAAC CATTGTACGG TTCGGCGACA GATTGGCAGT CGATAGAAAT 960
GTGATTTCTT TTACATTACT TGTG 984