EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41749 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:52975897-52977559 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr6:52976684-52976695GTTTTATGACC-6.02
CDX4MA1473.1chr6:52976684-52976695GTTTTATGACC-6.02
GSX1MA0892.1chr6:52976632-52976642TTTAATTAGG-6.02
Nr2f6MA0677.1chr6:52976332-52976346TGACCTTTGACACT-6.74
POU2F1MA0785.1chr6:52976650-52976662AATATGCAAATG+6.74
POU2F2MA0507.1chr6:52976651-52976664ATATGCAAATGCA-7.22
POU5F1MA1115.1chr6:52976651-52976662ATATGCAAATG+6.32
RREB1MA0073.1chr6:52975985-52976005CCCCACCCCACCCCTAAACC+6.35
RXRBMA0855.1chr6:52976332-52976346TGACCTTTGACACT-6.39
RXRGMA0856.1chr6:52976332-52976346TGACCTTTGACACT-6.19
RxraMA0512.2chr6:52976332-52976346TGACCTTTGACACT-6.27
ZNF384MA1125.1chr6:52977065-52977077TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr6:52977066-52977078TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
ACACATGTTG TTTTTGTAAA AAAAGGGGGA CATTACATAG GTTTCCATTC ATTTAATACT 60
GTTCAAACCC TATATTATAT TGCCCTCACC CCACCCCACC CCTAAACCCA ACCATGAGAG 120
GAGACTGTGT GCAGCTTTAC TCTCTGATTA AACTCATTCT GTAGGATTTA TAAGCATTTT 180
GAGAAATGAG GACGTCACCA ATGTCCTCAT ATTTCACCTC CTTTTTGTAA TACCTGTGTC 240
ATACCTGTCA TTATACAGAT TTGTGTCCTG GTATGTCACA AAAACATGTA CACACACACA 300
CACACACACA CACACACATA CACACTCTTG TATGTATGTA TGTATGTATT ATTGATCAAA 360
ACACTTTTTT TCCTCCTTAG CTAACAAGCT CTGGACTTCC GTTTTGGATG GGTGCAAAGA 420
GATGTCCACA CGCCTTGACC TTTGACACTA ACAATGTAAG TTTTACTCAC TTAATCTCTG 480
CATACAAACA CCGTGATCTC CCATCATCCC CTGCAGACGG TAATCTCTAA CCTCAGACGA 540
CTCACAGTTT CTCTCCTGCT GTGAAATAGA TACTGATCTT GATCACCTGA GATTAACAAA 600
GCAAAGAGAA AACATGTTAA ACCCCCAACC CTCACACACA CACTCACACA GATGAACACA 660
CAGTGACACA TTAGCAAACA GATCATGCTT TTCACAGAAA CACGTTCAGA GATCTGTAGA 720
AACACTCCTA AATATTTTAA TTAGGCTTCT ATAAATATGC AAATGCATAT TTTGTAGCCA 780
TTATTCAGTT TTATGACCCA TTGTTTCCAT TGTCTTGGTT CTTTATAAAC GTTATCAGCA 840
TCAGTTTTCC CCTAAAGGAA TTCTTCTCTT CTCATCACAG CCTATTTAAA TTGAAAGGTG 900
AACTCGTTTT GGGAAGTGTT GTTTTTTGAA TGCTCTACAC ACTTTCCTCT CGTCATTTCC 960
TGCAGTTCTG TTTCTGTGCG TGTGTGTGAT TGTGATCCAA CTTTTTCCAC CCTTTAGTTT 1020
ATTTCTGCCA ATCAGGGATG GACAGTATTT ATGGTACACG TATTTCGAAT ACCTATTTTA 1080
AATACATAAT AGCATTTAGA AATTTGTATT TGATGGGGTT TGTGAAGATG ACTTAATGTT 1140
TTGTAATAAA ATACTTAAGT GTCTTGTGTT TTTTTTTTAA ATACTGTAAA ATACTTTGTA 1200
AGAAGTCTAC ATGATGACGG ACATCATCAA AATGAAGCCT CAGATTGCTG CTTTCTCAGT 1260
TATTTGCCTA GGCTTGAGAT CAGAACAGAA AATTGATTAA GAAGGTCACC AATGCTTGAA 1320
GTATGGATGG AAATTTTGCA CACATTCAAG TCAATTCAGC TTTATTTGTA TAGCGCTTTT 1380
ACAATGTAGA TTGTGTCAAA GCAGCTTCAC ATAAATGGTC ATAGTAACTG GAACAGTGTA 1440
GTTCAGTTTT TAGTGTTTAA GTTCAGTTCA GCTCAGTTTA GCTGAGTTCA GTGTGATTTA 1500
GGCCGTACTC ACACTAGGTA CAGTTGCCTC GAACCGGGCC AAAGCACGCT TGTCCCCCCT 1560
CCCGTCTCCC CCGACGGCCC GCGCTCACAC CATATCGGGC CTCGGCACGC TTACGTCATC 1620
GCTGCTGCGC TGTTCAGAAG CGATCTCTAT GGCAATCCTT TT 1662