EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41726 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:52349949-52350826 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr6:52350246-52350257TATGTAAATAA+6.02
LMX1BMA0703.2chr6:52350234-52350245AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr6:52350235-52350248ATTTAATTAATTA-6
PHOX2AMA0713.1chr6:52350233-52350244TAATTTAATTA+6.62
POU4F2MA0683.1chr6:52350237-52350253TTAATTAATTATGTAA-6.53
POU4F3MA0791.1chr6:52350237-52350253TTAATTAATTATGTAA-6.35
PROP1MA0715.1chr6:52350233-52350244TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr6:52350233-52350244TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr6:52350233-52350244TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
GACAGACGCT GACTCAGACT GGCCAGCCCT GTCACCGGGC AAAGTCTAGA AGGTATACAG 60
CTGTGGATAC TCACCTCAAT ATAGCATATA ATATAGCATA CAATAATTTT TGTCGACAAT 120
AACCAATATT TTGACATTGC TGTGAGGGTT GGGTTTAGGG TACACGTTAA TAAAACACAA 180
TTTAATGGAT AATTTAATAA ATAATATAAA TATTACTCGT TATAATTACT GTTTTACATT 240
ACTGTGAGGG TCGGGGTAGA CGTTAATAAA ACACGATTAA TGGATAATTT AATTAATTAT 300
GTAAATAATT GTCGTTAATT TTCGGCTGCA GCTGTATCCC TTCTAGCAAC AACTCGTGTT 360
TTTGTCCCCA ACCACAAACC TGCATAGCAA CAAAACACGC CTCTCCTGTC AATGTGGATT 420
TCTCAGCCAA TCGGCATTGA AGTTCGGCGT GACGTCACGT TTGTTGACAC TTCCAGAGCG 480
TTAGCTAAAA CGTCACTGCA GCAGCGCGCG CCCGTGACCC TCGCCGTCCA CCCTGCGTTT 540
TCTGCCTGGA AACATCGCGA ACTAATCGGT GAAACGCTGG ATTCCGGGGG CTGGAGCCGG 600
TGTGCGGTAA AGTCCTGACG TGTCTCGGCT CGTTAACACA CAATATTGAT CTGTTTTTGT 660
CCCAGTCACG CTGACAAACG CTCTCTAAGT GCTGCTGCTT CTGTAGGTTT TGTTCCGTCC 720
TCAATGCATA GCTGTCTGCT GGAGGAAAGT GTGGCTGTTA CCACAGATAT AACGTTATCA 780
TATTAGAAAT TCAATTAAAG GTTCAGGTAA AGTTGGTTTC ATATTACATA TTTGGACATT 840
TACTTTAATA TAATTTCAGA AAAGTTACGT TATACTA 877