EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41679 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:50557325-50557813 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXC11MA0651.1chr6:50557747-50557758GGTCGTAAAAA+6.32
HOXC12MA0906.1chr6:50557747-50557758GGTCGTAAAAA+6.62
HOXD10MA1506.1chr6:50557747-50557758GGTCGTAAAAA+6.14
HOXD11MA0908.1chr6:50557748-50557758GTCGTAAAAA+6.02
HOXD12MA0873.1chr6:50557747-50557758GGTCGTAAAAA+6.14
LMX1BMA0703.2chr6:50557373-50557384AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr6:50557372-50557383TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr6:50557372-50557383TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr6:50557372-50557383TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr6:50557372-50557383TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
TATGAAATGC AATTGGGTAA GAACAATCGT AACATTTGTC AACCTCATAA TTTAATTAAA 60
CCCATTTTAT GGTGATATTG TGTCACAACA CATGAAACGC ATCACTTTAT CAGCCGTTAT 120
CGCAATGTGA GGAATTGTTA ACGCAATTTT AGGAGGGTTG TAATAAAACA CACACTCCAT 180
TGACAAACTG ACAAAACGCC TTCTTCATAC TGGGATGAAG TCCAAAAGCA GTAAGTCATA 240
TGACACTGCT TAACCATAAT GCCTACAGGA TATTTAACCG ATCCACACTT CAAACACAAC 300
CCTGGTGACT TATTAACTCA TTTATTGTAC AGTAAGTATA ATAACAGTGG TGTCACGTCA 360
AGAGTTTGTG CTGAATAGGT CGGCAAACAG AAAGCGTGTG CGCGAGTTAA TCTAACGGTT 420
AGGGTCGTAA AAACATTTCC TCCCTGAAGG TGTGGATTGC AACAGATGCT TCAAGGGGGG 480
TTAAACTC 488