EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41662 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:50460677-50461787 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GRHL2MA1105.1chr6:50461223-50461238ACAAACTGGTTTGGA-6.45
NR4A1MA1112.2chr6:50461692-50461702TAAAGGTCAC+6.02
ZNF24MA1124.1chr6:50461159-50461172GAATGAATGAACT-6.13
ZNF24MA1124.1chr6:50461155-50461168AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
TTGCTTTAAA AAATTAAGTT AACTCAACTT AAAATATTAT TTGGCACAAT TGTAACCACT 60
GAAGTTGAAT AAACTCACAT TTTCTTTGCA GCCGGTCGCT CTAAAATTTT AAGTTAACTT 120
AACTTTTTAT TGGGGGTGCC ACGGTGCCAC AGTGGGTAGC ATGATCACAG CAAAATGTCA 180
CTGGTTCGAA CCCCAGCTGG GTCAGTTGGC ATTTCTGTGT AGAGTTTGCA TGTTCTTCAT 240
GGCGTGGGTT TCCTTCGGAT GCTCCCGTTT CCCCCACAGT CCAAAGACAT GCGCTATAGG 300
TGAATTGAAT AAACTAAACT GGCCAAATTG TATGTATGTG AATGCAAGAT TGTATGGGTG 360
TTTCCCAGTG TTGGGTTGCG GCTGGAAGGG CATCCGGTTT GTAAAACATA TACTGGATAA 420
GTTGGCGATT ATTCAGCTGT GAAGACCACT AATTAATAAA GGGACTAAGC TGAAAAGAAA 480
ATGAATGAAT GAACTTTTAA TTTTTTGCAG CGCAACATTC TTTACAATAT CAAAAAAACA 540
AAAAACACAA ACTGGTTTGG AATAACTCTA GGGTGAGTAA ATTACGACCG AATATTTATA 600
TTTGGGTGAA CTAATGCTTT AAAAGAACTG TTTAAATTAC TTCCACTATA ATGAGGATGT 660
AAACTCTTCT TAATGCACCA TCAAAGCCCA TATGAACCTA TATTTCTAAG ATTTAAAATT 720
GCCAAAGCTT ACGCAATCAT CATATTAGCT GAAACGCACC CAACAAACTA TTTTGCGGCC 780
TGTGTGAAAG TGTATTTATC AGTGTTTGGG TTTCGGCCTG TCGGTCTGAT GTGGATTGAC 840
ACTGTTGTGT TTGCTTTCAT CACACTGACG TGTCTCTGGC CATATGTTCC CTCACAGGAA 900
GGTGACAAGA GACAGGAGCC ATGTTTGCCA GAGACATTCC ACTGCCTTCC TACTGTCATT 960
AAGACATGAA AGCAGATTTA AGAGCTGAAA CAACCTCTTT AAACACTCTT GACCATAAAG 1020
GTCACACACG CATTTTCATT CGTTATAATA ATTCATGCTG GAGAGGACAG AAAGCGCTAG 1080
CATCCCATTT AATGATTTAA AATTTATGTT 1110