EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41632 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:49548201-49549131 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr6:49549034-49549044GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr6:49549034-49549044GTCACGTGAC-6.02
Foxd3MA0041.1chr6:49548801-49548813AAATAAACATAC-6.11
MITFMA0620.2chr6:49549030-49549048GTCGGTCACGTGACTAGT+6.35
MITFMA0620.2chr6:49549030-49549048GTCGGTCACGTGACTAGT-6.35
Nkx3-2MA0122.3chr6:49548668-49548681TAATCCACTTAAA+6.13
Rhox11MA0629.1chr6:49548834-49548851TTGATTTACAGCGGCGC-6.11
SPICMA0687.1chr6:49548928-49548942ACAAAGAGGAAGTC+6.12
USF1MA0093.2chr6:49549033-49549044GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr6:49549030-49549046GTCGGTCACGTGACTA+6.34
Enhancer Sequence
ATGACACAGG CTTAACATGT ATCACAATGT TAGTTTACTC TATATCTCAC TTGTCAACTG 60
AGGGTAACTT TAAATGACTA CATGACATTG CGTGCTAAAC AGTAAGTTAC TAGGGCACGG 120
TGTGTGTGAA ACACTTTATG TTGTAGTGTA AAAGTGCATA CAGGCTGTAC TTAAAGTATG 180
ACACGTATTT TGTACGTTTT AAAGGTTATA AGCTAATGTT ATCCAAGCGT GTTAACCGGA 240
ATCGACCCCG GTGGTCAGGC TGGCTAACAA ACTGACAGTC AAGCTCCAGT CAACTAAACT 300
ACATTGGTAT GTACTATTTA ATTCAAAGTA CAACATAATT TCCACCATAA ATTATTTAAT 360
ACATCACATA TTACCTTGTT GGCTAAACCT AGCTGTTTAT TACAGTAAGG TTACTTTTTA 420
TAATACCCCA GGATGTTACC GTTAGCTCCC CAACTCGCAA CTAGTGTTAA TCCACTTAAA 480
ATTTCCCCAG GCAGGGACCT TTGTTCTTAC AACATCAGAA ATGTAAAAAT GGTATAAAAA 540
ATTATTAAAG TCAACAGTGA TAACATAGCA GATTCTCTTT AAACCGCCTC ATAAAGCTTT 600
AAATAAACAT ACTAAAGCAC GTTACCTGCC ATCTTGATTT ACAGCGGCGC TGTCACTCCA 660
CTTCCTCAAA AGATTTCCTG CTCTTATTTC AATCCCGGCA TCTATGTGAA GATCGAGTAC 720
ATATAAAACA AAGAGGAAGT CAACGAAACA AAGCACTTTA TAGCGAGTAA ATAGCGCAAA 780
TTCCCGTATC ACTCAACCGA ACGCTCGGTG AGGAAAAAAA TAAGACAATG TCGGTCACGT 840
GACTAGTCTA CAGACGTCCG ATTCGTGAAT GAGTTGTTCA CATGAGTCGG ATCTTTTCCG 900
GGAATCAATT GAACCGTCTC ACAGAAAAGA 930