EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41617 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:49320568-49320998 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr6:49320981-49320991TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr6:49320981-49320991TTTAATTAGA-6.02
HOXC11MA0651.1chr6:49320845-49320856GTTTTACGACC-6.14
HOXC12MA0906.1chr6:49320845-49320856GTTTTACGACC-6.14
HOXD10MA1506.1chr6:49320845-49320856GTTTTACGACC-6.62
HOXD12MA0873.1chr6:49320845-49320856GTTTTACGACC-6.02
Hoxa11MA0911.1chr6:49320844-49320856AGTTTTACGACC-6.74
MIXL1MA0662.1chr6:49320632-49320642GTTAATTAGA-6.02
PHOX2AMA0713.1chr6:49320983-49320994TAATTAGATTA-6.32
POU1F1MA0784.1chr6:49320627-49320641AATATGTTAATTAG+6.88
POU1F1MA0784.1chr6:49320751-49320765GATATGCAAATTAG+7.19
POU2F2MA0507.1chr6:49320752-49320765ATATGCAAATTAG-7.04
POU3F1MA0786.1chr6:49320752-49320764ATATGCAAATTA+6.74
POU3F2MA0787.1chr6:49320752-49320764ATATGCAAATTA+6.74
POU3F3MA0788.1chr6:49320751-49320764GATATGCAAATTA+6.09
POU3F3MA0788.1chr6:49320627-49320640AATATGTTAATTA+6.36
POU5F1MA1115.1chr6:49320752-49320763ATATGCAAATT+6.62
PROP1MA0715.1chr6:49320983-49320994TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr6:49320983-49320994TAATTAGATTA-6.32
Pou2f3MA0627.1chr6:49320750-49320766TGATATGCAAATTAGT+6.35
Enhancer Sequence
TTTTATACAG CACAGATGTA GTTTTGAGTT GATTATGTAA TGACGACATC GCGCAAAGCA 60
ATATGTTAAT TAGAACCTAT TTATATCTGG ATGTAATGTT TAAATATAAC ATAATACACT 120
GCACCTCGGA GAGTAAAGAC ATGACGGGCT TACGCTTGCC AGATATTACA AGATGACGTG 180
ACTGATATGC AAATTAGTGC GTGGCAACTT CTCGGCCAGG CTTTAGCTAC TTTCATTAGA 240
AATCTATAAG GGGCGTCTGC AGACTTGGAT CCAGGCAGTT TTACGACCCA AAATTTTACG 300
GCCCTGTTGT TCCTAATGCG TCCAGTTGGG GGATGAAAGA TAGCCTACAT GGCCAAATAC 360
ATTTGAAGTC AACGCTCCCA GGTTATTAAA TGTCCTGTTC ATAAATATAT ATTTTTAATT 420
AGATTACGCT 430