EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41431 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:43352058-43353406 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr6:43352475-43352487ATGTAAACAGTA+6.11
Foxj3MA0851.1chr6:43352121-43352138AAAAGGTAAACAAATAT+6.93
ZNF384MA1125.1chr6:43352106-43352118AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43352107-43352119AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43352108-43352120AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43352109-43352121AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43352110-43352122AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43352111-43352123AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43352112-43352124AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43352113-43352125AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43353263-43353275TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr6:43352105-43352117TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr6:43352104-43352116TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr6:43352103-43352115TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TTTTAGATAT AAGCAAGATA AGTTTGCGAA ATACCTTGGT ATTTCTTTAA AAAAAAAAAA 60
AAAAAAAGGT AAACAAATAT TAACGTAAAC ATAAGAGTTG GCCAATGAGA CCGCTGGGAT 120
TTTCCATAAC CTGTCCTTAA TCATCCGGTC CGATGGTCCG CACATTGGGT CTCGCATTAG 180
GAACGATTTC TGAGGTAAAT TTTCAATTAA ATGTTAAAAA AAATGCGTAC GGGTGCTTAA 240
ATTGGCTATA TTCAGACAGA TATATTATGA ACTAATTGTT TTTGAGAAAC AAATAAATCG 300
TTATTAAGCA TTACTATTAA ATTAGTCTTG TGAGGGAACT ATACCGGATG GTGTGTGACG 360
AATTTTGTCC TCAGTCTAAT TTACTCGCAT TTTATACCTC CTGTTCGTTA TTTTGCCATG 420
TAAACAGTAT TAATTCAGTT TGTAACGTTT GACCCCTTAA CGTTATATGC TTTATAAAGA 480
AATGCCGTCG TTTGTCACTA AATAAACTCT TGACTTTTAT CCCAAAAGTA TGCATTTTTT 540
CTGTTAGTCT CCAGATTTGA TGAAATATTG ATGGATTCTC ATGTCTTTAC TTGATATTTT 600
ACCCATACTG AGGCGATGAA CTTAAGAGCT TCATGCCCAT TTCATTCATA CGGGAAACCA 660
GAGGGCGCCA TACATAAAGG CCTTTGGCCT AGCGCAGGGG TGCTCAATCC TGTTCCTGGA 720
GATCTACCTT CCTGCAGGTT TCAGTTGGTA CCCATATCAA ACACATCTGC CTGTAATTAT 780
CAAGTGGTGT GCAGGTCCTA ATTTTCAGGT GTGTTTGATA TGGGTACCAA CTGAAATCTG 840
CAGGAAGGTG GATCGCACGT AGATATTTAC ACGCACGTCG TCTTTCCTTT GTTTACTAGC 900
GTTGCTAAGC AACGCAAACA GATGACAGTA AAAACTTAAC CCGTTATATA AGATGTAGTA 960
AAAGCATTTT CATAGTATTC TCATTTTGTA CATTTTATTT CTCATTCTGT GATAAGAATT 1020
TAGCCTAATG TAACCTTAAT AAAGCAGCAC ATAAACCACA AAAGTAGTTA AAGTGCTGCT 1080
TAACAGACAG ACAAATAATG GAACTTTACA TCTTTATCTT AATAGACACA TATTCATCCA 1140
TCCCTGTGTA TTATTTGGCA CGTCTCCCTT TTCTCCACGT TTTTCCCTTT TCAATTCAAT 1200
CATTGTTTTT TTTTTTTGGC ATGACAAATG TATTGCCAGA TATACAATAA ATTCCTGTCT 1260
ATGTATACTT AATATTCTAA TGGTTCGACA TTATATATTA ACAATAACAA TACAATTTAT 1320
TCCTGGCTCA AAATAAGGCA GAGGTGGT 1348