EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41285 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:38942749-38944727 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Dlx1MA0879.1chr6:38944016-38944026GATAATTAGG-6.02
E2F7MA0758.1chr6:38944598-38944612ATTTCGCGGGAAAT-6.5
E2F8MA0865.1chr6:38944599-38944611TTTCGCGGGAAA-6.62
FOXD2MA0847.2chr6:38943152-38943165ATGTTTATTTAAC-6.36
FOXE1MA1487.1chr6:38943086-38943101TCTGTTTGTTTAACA-6.03
GLIS2MA0736.1chr6:38943840-38943854GCCCCCCCGCGGTG+6.03
LMX1BMA0703.2chr6:38944323-38944334TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr6:38944320-38944333AAATTAATTAAAT+6.07
POU5F1MA1115.1chr6:38943049-38943060AATTTGCATAT-6.62
ZIC1MA0696.1chr6:38943840-38943854GCCCCCCCGCGGTG+6.44
ZIC3MA0697.1chr6:38943840-38943855GCCCCCCCGCGGTGC+6.74
ZIC4MA0751.1chr6:38943840-38943855GCCCCCCCGCGGTGC+6.82
Enhancer Sequence
AGGCCAATAT ATCAATTCAC GCATGTCTTT GAACTGCGGG ACAAACCGGA GCACTCGAGG 60
AAACCCGCGC GAACACGGGG AGAACATGTA AACCACATGG TGCCACTGCC AACTGACCCA 120
GCCTGGACTC GAACCAGCGA CCTTCTTGGG TCACCGCACC GTGCTGCCAT CAGGTAATCT 180
TTTTTTTCTG TGAAATTCTG TAGTACACAT CCAGTGGCGT AGCGCAAAAT GTGGAGGCCC 240
CCCTGCAGGG ATCGCTGACG GGGCCCCCTG ATGAAGAGGG GGGGAGATAC GTCATACGCC 300
AATTTGCATA TCACTGACGT CATCACGTTT TACCGTTTCT GTTTGTTTAA CAGCCTATGG 360
TTAATAAAGG GGTATTTATA ATTGCACTAC ACTTTATATA AGCATGTTTA TTTAACTAAA 420
TGTATTGCTG TTTGAATACA GCATGTCATT ATAGATGTGT AGTGAATGTG CAGTAATCTC 480
TCTTATGTAA TAAACTCAGG CAAGTTCAGA AACTGTCACT AAAATATCTG TGATTGTGAA 540
CAAGAAAAGA ATAAACGGTC CAATTGAATT GTTAAAATAA AGTAGAAGTA GATCGGTTTG 600
ACTGTACAAG GGAAATACCT TCACACTGCC TGTGCTAAAT CATTTGTCGT CGGTACGCAG 660
AGGGGTGATC TGCTCTCGGG CTGCAGGTGG GAGAGGCTGC TGTAGAGGAC TGACTGGGCC 720
GCCTGTCAGT GCTGTGAGGC GGGGGAGGGG CCGGCGGCAT CACACGCAGC TCGTTGAGAA 780
GAGTAGGGAC GGTACAGTAT GGACAAATGA CAGTCTAAAA AAATCTCCAA TAACACACAA 840
AAAAGTCGCT AGATTTGTCG TTAGGGGGGT CTGAAAAGTC GCTAAATCTA GTGACAAAGT 900
CGCTAAGTTG GCAACATTGG CGGCAAGCAA TCAGAATGAA GTAGTCCACC GCTTGAGAGG 960
TGTTCAGAGA ACACAGACCT GTGAACTTTG GTTCCGACCA CAGTTGTTCC CAAGAGTTTG 1020
ATTATTGCGG TTGCCGGTTG ATTTTCAATT ATTGAAAATC GCGACGACGC GGGGCCCCCT 1080
AATCACGCGG GGCCCCCCCG CGGTGCGTGC CCTGCGGGCC CATCCGCTAC GCCACTGTAC 1140
ACATCTGAGA ACACTTTACT ATCCAATGAT GAGGAGAGTA TTTGCGAATG GCTGAACGTG 1200
ACCGCTCAGA TCGAATTGAT TTAGAATCAA TTTTCCAAAA ATAAACAGAA AATAAACATT 1260
TATATTTGAT AATTAGGTTC CACAATTTAC TGTAATTAAT CGTGAACATG GCTGTAGGCC 1320
TACTAGACAA TGAATAATTG AACAAGTACA TAACCGCTAC ATAGTTAAAA GGAAAAGGAG 1380
GGTTAACATG CAAAACAATC TAACGTTAGG CCTGAAAATG TTTGGCGAAC AGATGAAGTG 1440
GGCTAACGTT AGGCTTATTG AGTGAGGCTA ATTTTTTCCT GCGGAAATTT GAAATCCTAC 1500
AGTGCGCAAA ACTACTACTT TTCAAATCAA AAAAGAGTTA TGCCAAATTC AAATAAAGCT 1560
TTTAACAAAG CAAATTAATT AAATTTATTA AAATATATCC TGACCATTCC AGGATGGTGG 1620
CTCCGTTCAT AGTGTGGGGT TCCAGTGGAT TTAACATCGC TGTCTTCAAG ATGATTCTGA 1680
TTTTGCAAAA CATGAAAAGT AAAAGTAACT GGAGGTTCTC AGCGCCTGGA AGGCAGCAGC 1740
AAAAGGATAG ACTTTCAGCC TTGTTGCCTC CGCGTGTCGA ACATCCCCAT CTCGTGGCCA 1800
CAAGCATAAA TGATAGTGTG CTTAAATGCT AGTCAGTTCA CTTCGTCAGA TTTCGCGGGA 1860
AATTCTTATG GATTCGGCGA CTTAAACTGA TTTGATTTTT CAGGGATTTT TGTTAAATAG 1920
TCTTACATTT TGTAATCTTT CTCAGATTCT TTAATGTTTC ATCTATTTTT TGTTTCTT 1978