EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-41234 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:37427096-37428161 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr6:37427166-37427178CAAATCACAGCA+6.52
Gfi1bMA0483.1chr6:37427167-37427178AAATCACAGCA+6.62
HNF4GMA0484.1chr6:37428063-37428078CGAGGTCAAAGGTCA+6.47
NR2C2MA0504.1chr6:37428063-37428078CGAGGTCAAAGGTCA+8.12
Nr2f6MA0677.1chr6:37428064-37428078GAGGTCAAAGGTCA+8.42
RXRBMA0855.1chr6:37428064-37428078GAGGTCAAAGGTCA+7.95
RXRGMA0856.1chr6:37428064-37428078GAGGTCAAAGGTCA+8.12
RxraMA0512.2chr6:37428064-37428078GAGGTCAAAGGTCA+8.12
SMAD3MA0795.1chr6:37427125-37427135TGTCTAGACG-6.02
Enhancer Sequence
TAGAGGCACA GTGCGTGTTA GCAGAGGGGT GTCTAGACGT GACGCTTCCA GGTGATGTGG 60
AGCCAATTTG CAAATCACAG CACATTATGT TAGCTGACCA ATCAGGTCAC TTGAAGGCAG 120
GCCTTTCAGA GGAACTAGGA AATACGAAAG TCGTTTTTAT GTTAACTGAG TAGCTGTATA 180
TAATCAAAGT AAGATGCATG AACAAATAAC GTGATTTACT ACAAATGAAG CATGAGCACA 240
CAATGCTTTC CATTTTATAA ACACAACCAA GCCCCAAAAT TACACTCTGG ACCACCACTT 300
AGGAGTCTCT TTAACTTTTT GGCATTCTTT AGTCTCTGGT TAAAGTTCTG TACTATTAAT 360
TTCTGTTATT CCACAGCCTT CGATATAAAA TAAAATTAAA ACACAAGCCT TTGGATGAGA 420
TGCCTTGCTG AAGAAAAAAA AACAGCATGA GGTCATTGCT TTTGAACTGC TTGTCTAAAG 480
TAAGCAGGTT CTTGCCAGCC ATAAGCTGGT TAAAACTAGT TTTGGCTGTT TTGATTATTT 540
TGTTTTTGCA GGGTATTACT ATTCCTACAC CAAAGTTGTT TGAGGACCAA AACCTGACAA 600
ATGTATTGAA ATACAACACC CGAGCAGTCT TGAGGAGTGG TAACAGTATA AGCGGAATGA 660
TTGGCTCAAA ATTCAGCTTT ACTTCATGGT CCCATCACCA CCTTGTGTTA TTCCTTACAC 720
ATAAACTTTT ATATAGGGTT GAAGCCTTTT GTAAATTATT TAAGAAAATA GATGCATTCT 780
GAAATCTATT TAATTTCAGG AAGGCAGGGG CTTGAACTCA TTTAATGAAT AATTCGTCCC 840
CAGTTTCTGA CCACTATGCT TGGATTAACC TAAGTTAATG AGTGGAGTGG GTTCGCAATT 900
ACATCTCAGC AGGAAGAGAG AACAACACCC TATTCAAGTT TTCAAAGGGA GGCCACCCTA 960
ACAATACCGA GGTCAAAGGT CATTCCATCT GAGCTGGTCA GACCTCTGCA CTCTTTTGTG 1020
CTGCACTGTT TTGGTTATGC TGTTTTCGGG AAATTTAATT ACATG 1065