EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40959 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:29728684-29729757 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2CMA0497.1chr6:29729478-29729493GTCTATTTTTGGAAT-6.76
RARA(var.2)MA0730.1chr6:29729104-29729121TGACCTTCACATGAACT-7.21
Rarb(var.2)MA0858.1chr6:29729104-29729121TGACCTTCACATGAACT-6.63
Rhox11MA0629.1chr6:29729131-29729148ATGTTTAACAGCGTCCA-6
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr6:29728947-29728958TGCCTCAGGCT-6.14
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr6:29728947-29728958TGCCTCAGGCT-6.32
Enhancer Sequence
CTCTTACATG ACTCTGGTTT GTCTCAACAT AATTAGATCA TAATAAGCCT TTTGTGTACG 60
TGTGGAGATG AACTGTATCA GTATCAGGCT TGCTAAAGAG CCCCACTAGG TGTCACCCAA 120
GACCAATACT GTCCTAAATG GCCTCACAAT ACATTCATCT CCTCGTTTTG TCCGCCAAAT 180
CAAGTGTTTG AGCTCATACT GAAGTCAAGT TTGTAGTTTT TATTACGTTC AGCCGTGTTA 240
ACCGTGACGT TGCGCACGTG TGGTGCCTCA GGCTTCAAAG CTTGTATTCA CTCCTAATGG 300
GGCCTTAAAC AGTGTTTCTC TACAGCGAGA CTGTTTGGAA AAGAGGGGGT TGGCAGCACA 360
TGCTTATTCA TGAAGGTGGG CTAGGTCAGG CGTCTTACGC TTCTGAATGA TACACAAGCA 420
TGACCTTCAC ATGAACTCTT GCTGTGGATG TTTAACAGCG TCCATATTTT TAGCCAAAGA 480
CTTTTAAGTT CTGACTGAAC ATGAACTGTT TTATCTTAGT AAAGGAATCT TGAACTGGCG 540
TCTTATCTAT TTTAGGCTAA CTTTAATGAT TTTGAGATTT TAAATGATAA TAAAAAACAA 600
AATTATTCAA AAGAGATAGT TACACCATGT AATTTTGTAG ATTAACCGAT ATCTAATAGA 660
CGACTAAACA GATTTTTACT GTCAGACCAA ATTTAGCTTT GTTTAGCCAA GATGTCTAAT 720
AGATGTCTAA AGTCCAAAAA TAGGCTAGTC ATCAAATAGA CAGATTAGAC ATATTTCATG 780
TGTCATTCAT TCCTGTCTAT TTTTGGAATA GATGTCTGTT AGATTCTCAC TGACCGTACT 840
GAAAAAAACA GCTTAAACCA GCCTAGGCTG GTTGGCTGGT TTTAGCTGGT CGACCTGGCT 900
GGTTTTAGAG GGTTTTTGGC CACTTCCAGG CTAGCTTCCA GCCATTTCCA GCCTGGTCTC 960
AGCTGGTCAG GCTGGGAGAT GACCAGCTAT AACCAGCTTG ACCAGCCTAG CCAGGATGAG 1020
AGCCCAGCCA AAACCAGCTA TGTCCAGTTT AAACCAGGCT GGTTTTAGCT GGA 1073