EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40953 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:29254990-29256408 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr6:29255596-29255610TGTGTTTACGTTTG-6.14
MecomMA0029.1chr6:29255698-29255712CTTTATCTTATCTC-6.36
POU4F3MA0791.1chr6:29255886-29255902ATACATTATTCATGAA+6.01
Enhancer Sequence
GCTTTGTAAT CATAGGAAAA CACAGTTTAA AACAGTTTTT AAAATGATAG CAATAAAATT 60
CTATTAGCAT TCTATAGCAT TAATGCTTTT ACTTTATTGT GTTCTTGTCC TTGGTGAACA 120
TTAGAGACTT TTATTCAAAA CATTAATAAT CTTTGAATAG TGATGCAATC TAAACAAGTT 180
GTTTTTCTAA ATCCAGCTGC TCTAACCAGA AACAATATAG CCTTTCTTAA CAGTGCTTTG 240
TTTAAGCTCA AGAGAAACTT CTATTGAAAA TCCAGTCTAC TTCAGTGATT TATGTCATGT 300
CACACCCATA ATCCAGCAAA AACTTGATTG TTGTTAATTG TCTTTGCACT TAATCTGCAG 360
GTTACAACAT GTTGGCCTAT CATATTTCTC ACAGACAGAT ATAACAGAAC TACAATAAAC 420
ACGTGAGACA AATGTCAATT GTGCTTTGTG TGTCTGTGTA GACAGGCCTT GACTGAGAAA 480
ACCACACTAG AGCAAGCATG CTAGATTACA AACATAATAG AACTGAATTC ACTTAAAGAT 540
ATTTCACAAA CTTCCCCATA CGCTGTAGAG CAGTATTAAA AACATAACTT TTCCTCCATT 600
ACACATTGTG TTTACGTTTG ATATATTTGG AGGACATGAA TACACAAACT GTTCTGAGTC 660
CACATGCTCT TGTCTGAAGT ATGCAAACAC AGCGTCCAAA CATCAAATCT TTATCTTATC 720
TCCATTGTCT GTGACAAATT CCCACTGTAT AAGTTTACCG GGGTACAACT GGGTTACCTT 780
CGTTTCCAAC TATGCGGAGC TTCAGTTACG GTATTTTGGC ACCTGGAGCA GAAAGCCAGT 840
CAGTCATTGA CAGGCATTGA GTTGAACTTT GTCAGTTGAT ACGATCTGTC GGCACAATAC 900
ATTATTCATG AAGTCCAACA CCATATGAGA CTTAAGCACC ACTAAGAGAA CGAGACCTTG 960
GTGTGTTCTC ACACAGAAAA CAAATGGCTA ATTTCTTCTG TTAAGCCTCG GACAAAAGTC 1020
CATTTGGAGT TCTTCATATT CAAACAGCCA CATGCAGGAA GCTAAAGAAT GCAAAAAGGC 1080
AGACAATAAC AGCAGGTATC GACACAAAAC TCTGAGAGTG AATTCTTGTA TAAGGTTGGT 1140
CTGTTCTAGG AACACAGCAG AATTCAATTT CAAAGAATTC ACACATCGGA AACAACCTTG 1200
TAACTGGTTC AAGGGAGTTT TGTCTGGAAA GACACTGTGA CACTTGAGTC AGAGCGTTAA 1260
GTTACACTGA ACAGTACTTT CATAATATGA TGGAACGTTG AAAGGAAAAT GTCCCAACAC 1320
TTGACCTGAG TTTACAACTT AGAGCCAACA AGATCCATCA TTTTTTCACT TTCCTCTTTG 1380
CTCTTTTTCA CCTCTATAAA CAGGATGTAA AGATCTGC 1418