EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40905 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:28252535-28253684 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:28252635-28252654CTGCGCCACCTGGTGGATC-6.15
Foxd3MA0041.1chr6:28252668-28252680AAACAAACAATC-6.92
GSX1MA0892.1chr6:28253186-28253196TTTAATTAGG-6.02
Enhancer Sequence
AAAGCCAAAA AGAAAAAAAG GAGGAGAGCA CAGAGAGAAA GAATTCTGTG TTTTGGAATC 60
TTTCTGTTAT TTCCCTCAAG TACAGGATGT TTTCTGAGGT CTGCGCCACC TGGTGGATCA 120
CAAAAAGAGT GAAAAACAAA CAATCCTCTG ACATGTCAGA TGGTGTAAAT TACGCAGTCC 180
GGTTTGTGCT TGTGCAGTGT GTTCGCTATG CAGTTTACGA CTGATCCAAG CATTTAGAGT 240
GAGCTCAGAT CAGGTTAAAC CTGTGAAGCT TCCGTTTCGA AGCAGTGACA GTAACTCATA 300
CTTTTTCCTC ATTTCTCGTC GTCCTTCAGA GAACGCAGAT CGGATTGTAA GGCACCAAGC 360
CAAAATGTGA AATTATGACA CAATCCCATC CCTTTGGCTC TCTCTCTACT CTAAACCTAT 420
CTTGAACTAC TTTTCGAGGA AGCTTATTTG TTGTTGTCAT TGTCTTAAAG TGTCAAGGGA 480
GCTGGTTGAT CATTATCAGA GAAATGCAGT ACTCGGTGTT CTGTCTTCAG CAGTTGCATC 540
CGCACTCAAA ACTCCACAAA ACGCACATAA CCACGATGCG CTTTTAAAAA TATATTGTAT 600
ATTTCCGAAG GCTTGTGTGC TATTAAGGTT ATGCACTCTC ACTCCTCCAG ATTTAATTAG 660
GCGCTAATCT CAAAGAGAAG ATGTTTCAAA TCCATTCATT TGAACGCGTG CTATTTCCTT 720
CTCTCCACAC CTTGCTTTAA ATTGTGGCGC AAGACTAATT TCTCAAACGG CCTAATCCCT 780
TTATGAATCG CTCTTGCGAT ATCATGCTCT CTTGTGGAAC TGGGAATTGG AGAAATCTGT 840
TGGACTACAT TTTTATGCCA AACAGAGCGC TTCTTATCAT TGGAGAGACT TAAGTTGCTG 900
CCACTGGGAA TTAAACCGCT AGATGGATTT TTTCTCCGAG TTATTGGAGA TCTCAATTAT 960
GCGCTATTTA ACTATCAGCT TTGCCTGATG TTTCACCTAA AATAAAAAGA AACAGATTCT 1020
ACAACTGTTG CTAACAGACT TTTTTTTTCA TGGATAGGTA TCGAATTTTA TCCATAAGAA 1080
ATATATAGGG GAGAGCGGGA CACAAAGGAA CTCTTTTTTG TTTTGACCAA ATAATGAACG 1140
AAGTAGCGG 1149