EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40484 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:13886732-13887858 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LHX2MA0700.1chr6:13887713-13887723GTTAATTAGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr6:13887723-13887736AAATTAATTAACA+6.19
POU4F3MA0791.1chr6:13887075-13887091TTGAATTATTCATGAT+6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr6:13887112-13887129TGAGCTTACGGTGACCT-6.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr6:13887112-13887129TGAGCTTACGGTGACCT-6.56
Enhancer Sequence
CTTCATGTTT AAGGATCACT TTATTTCTAT TGTTTATGGG GGACTTTTAT TTTGACAAGA 60
AATCGTTTTT TCAGAGCTAA AAAGTTATGA TGAGAGAACA GTATGGATAG CGGACATTTC 120
ATGACGGTTT AACAGAGCTC GTGTTAAAAA GGACGGTTTG TAAGCTTATT TCTCGCTGCC 180
AAATATGTTG AGCTTCTTTA AAGGAAGTGG AGCAGATGAC GTAGGCTCAA CGTAGCCATT 240
GTGTAACGAA ACGATAGCTC GCATCACCAC ATTAATATTC ACGAGAAGTA TTACGAGCTG 300
TTACGACAGA CACAATCATC GTGACAACAC AGCTACGTTT TACTTGAATT ATTCATGATT 360
CAGTGACCGA AGCACTACGC TGAGCTTACG GTGACCTTAC CTCATCATCC AAGATCATGA 420
CGGGAGAGTA ACGCACACGG AAGTGCGTTA AGAAATACAA ACCGAAAGCA GCAAAATACA 480
AAGCAACAGA GTTTTGCTGC TGTTTAATGT CGTTCATCAT GGGTAACACT TTACAATAAC 540
AGCATGAATA ATGATGTATT AATATGTAAA CTAAACATTA CTTTATTATT AACTAATGAT 600
GAGTTAATGC ATGCCAATCA TGAATTAACT TTAAGCATGA GTCACATGAG TTCATGTGTG 660
AATAACGGCT ACCTTAATTG TTAGTACATG TTTATGTCTA ATTTAACCAT CATGAACTCG 720
TGATATGTTA ATGTATAATT ATATTGTGAC TTTTCATGGT AGGGCACATC ATCATTAATC 780
CATTCTTAAC TACTCATGAA CTTCCCATGC ACGTCCATCT AGTATTTTTA CACTGAATAA 840
CAATAGTAAA GTGTTCTGGC AGCATCAACA TGAACAGGAA TTCATGAGTA GGTAATGATG 900
AGTTAATGGT GATGTAAATG ACATAATTAT ACATTAACAA CTCACAAGTT CACGTTAGTT 960
ACATTTAGCT TAAACTTAAA TGTTAATTAG TAAATTAATT AACAGCATGT ACTAACAAGT 1020
AATTAAGGTA GCTGTTATTC ACACATGAAC TCATGTGACT CATGTTGTAG TTTACGTTAG 1080
TTCATGATAA TTGCATGCAT TAACTTATCA TAAAATCATT CATTCA 1126