EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40408 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:11161561-11162637 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr6:11161836-11161846GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr6:11161836-11161846GTCACGTGAC-6.02
CremMA0609.1chr6:11161727-11161737TTACGTCATA-6.02
Hmx2MA0897.1chr6:11162577-11162594GTAAACAATTAATCAAT+6.35
Hmx3MA0898.1chr6:11162577-11162594GTAAACAATTAATCAAT+6.12
PBX2MA1113.1chr6:11162600-11162612TTGATTGACAGC+6.32
RUNX1MA0002.2chr6:11162491-11162502GTCTGTGGTTT+6.62
Enhancer Sequence
TATATATATA TATATATATT AAAAGATATT CAGATGTGTT TTCTTTCTTT AAAACTACTT 60
TTAAAAGTAA AAATGTAAGG GCAGTGACTG TTTTGCCATG CTATATTTAA AGCTGCAGTA 120
CAGTATCGTC TTGCGCAACA CAAAGCTGAA CGCCATAAAT ATGGAGTTAC GTCATATCAG 180
GTAATGACGA AACGCCTTCT GTGCTGTTAA AGGTTTTTTG ACATAGAACA TGTGAAAGAA 240
AACAGCACAA CCACTAAGCA TTTCTGCCTT TCTGAGTCAC GTGACGCCCA GTGCCGCCTG 300
TGATTGGTTG CCCGATTTGC CTTCACAAGA TGAAAAAGTT CTAAATCGGC GTACATAGAG 360
TGGAATTTAA ATGGATAAAA TGTAAGTAAT TAAAGTGTGT GTTTTTATTT AGCTTGTGCC 420
ATTTTAATAA TAACTTTTCG AAAAGACAAA CTCCCTAGCG CTAAACCGTG GTGTAAAGGA 480
ACTTTAATCT CCGGGCGGAG TGCAGAGTGG GAGGGCTTGA CCGATAAACA GTGCCATGGT 540
GTCGCAGTTG ACAAATCAGT GACGCAGAGC ACGGCTACGG AAGGCTATTG AAACACGAGT 600
GGCTTGAATT TTCGGTTGCG GGATCTCCAC TATAGACCTG GCCCCAACAA ACGAAACAGA 660
GTCTTATTCT TCGTGGTGGT TTGTAATGTA TGAATGGATA GCTGACGTAT TATCGTCGCT 720
GTTCCTGCCT CTTTCTGCTG AGAAATCCGA AGACTGGCCT AGTGAGCGCG CAAACGGTAA 780
AGCGCGAGCC GCGGCCACAG ACACTCAGCG GCAGGAGAAC AGCAGGCCCG CCAAACGCAA 840
CTATCAGAGG TATTCGTCTT TTTCTTTATG TCTGAATGAA AATTTGTGCT TTTGTGTTTA 900
TTACACAGTG CCTTGCATAG ACATGTGCCA GTCTGTGGTT TGTTATTGTA AGTTACCTGA 960
ACAATAGCAA GTGTAGCTTA TTAGCATTTG ACTTCAGGGT CAGGAATCAG TCCAGTGTAA 1020
ACAATTAATC AATAGACGCT TGATTGACAG CAAACAATCA CAATTAAATT AATGTT 1076