EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40391 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:10629504-10630341 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXC13MA0907.1chr6:10630238-10630249TTTTTACGAGC-6.62
LMX1BMA0703.2chr6:10629830-10629841TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr6:10629827-10629840TAATTAATTAAAT+6
ZNF384MA1125.1chr6:10629767-10629779TGTAAAAAAAAA+6.07
ZNF384MA1125.1chr6:10629770-10629782AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:10629771-10629783AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:10629772-10629784AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:10629769-10629781TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
TTGTAATGTA CATAAAGTTG CAATTAAAAT AAGTATGACA TTTGATAAGC TGTACTTTAT 60
TTTATGATGA ATCGCATAAA GCCTATAAGC GACAGTCACG CACGCACACC CGCTCACAAA 120
GAAATACAAA AAACAATGAA ATAACGAGCT TTATAGGCTA ATATATATGA CCTATAGTAA 180
GGCCTTAAGG TTATATATTG TTCTTCGCCT ATATCAGTGG ACAAATCTAT CCAATCTCTG 240
TCAACCCCAC ACATGGCTAT ATTTGTAAAA AAAAAAAAAA TCCGACATAT TTTTCTAATT 300
ATAAAAAAAA GTAATATGCC ATGTAATTAA TTAAATTGCC AACGAGTGTG AACTAAACTC 360
TAATATATTT ATACACGTTT TTAGGCTACA TTTTGTGCTG GAGAGCAATA AACACGGAGA 420
TGACAAAAGA GGGAATTTAT GACTTTGTTT TAAGACTTAG GCTTTCACCT AGATATTCTT 480
CTTCGAAATA ATAAAAAATG CACGATTTAA CTTGCAAAAA CATTTTGGAG ATGTGCAGAA 540
ACACTTTAAT GCTGCCCATT GCTGGACTTC GCCCCATATT TTGAGGTGTT TCGGGCGTTA 600
CTGTCCCTTT CGTTTGTTCG GTTTTTGTAG ATTGTAAATG GTAAGCTGGC AACGCCACTG 660
TGGGGTAGAA AATCTGCGGT TTCTAAGCTC TTCCCAGCTC AAAAGTTGAT TTACAGCTCA 720
GGTTGTAAAA AGGGTTTTTA CGAGCCTCGC GCGTCCGTCA TTGGGCATCA CAGATGAGAC 780
GCGCTATACG GGCGCGCGCT GATATTGGCT CCTCTCTTCC CACGCGCTCT GTTGCAC 837