EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40387 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:10544756-10545971 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK1MA0852.2chr6:10545512-10545526GCCTTGTTTACCTG-6.3
LMX1BMA0703.2chr6:10544938-10544949ATTTTAATTAA+6.62
SRFMA0083.3chr6:10545834-10545850TAGCCATATAAGGGCA+6.57
Enhancer Sequence
CACAGAAAAC TGTTCCCACT TGTATTACCC AAACCATGGA TCCTAAAATT CCAATTAAAT 60
GACAACTATT AATTAAACAT AGTTTTACTA TAGTTAATTG TGGATATTGC TGTTAATAAT 120
GACCACAACA ATAACACATC AACAATCATT TAAATTACGA TAACAACAAA TCGTTGATTT 180
TAATTTTAAT TAAATGAAAA ATAAATTTGG ATACTGGCGA ATTGTAGTCT ATAATAATAA 240
CAACAACAAT AATAACATGT ATACAACATC AAAACCGTTA AAGTTTATTC AGAAATAGAC 300
ATAAATGTTA TTTCTTATAA ACAAGGCCAT TGAGTACACA TCAAAATAGC TACATTTGGC 360
AGGAATATCT CGCAAAAGAA AATACATGAT AAAAATAGCG ACTGTTGAAG ACGTACCGTG 420
CGTTCAGGTG TCGAGATGAT CGATACATGG ATTGTATATA ATGTCATTAA AGAAAAACAC 480
AGTAGAAACA TCCATGCTTA CACTCTGCTC ACAGCATCAC GAGCGCTTCA GCACTCCGTT 540
ACTTTCAATG TCAAATCACT GAATGACTGA CGCGAGATTC CGCCTATGTT GTCGAAAAGC 600
CCCGCCTTAG TTCATCTGAT CATGGCGCTG ATTGGCGGAA ATGTAGGAAC TATGCCGAAA 660
TAGATGGAAC ACTTGCATTC GATTGGCTAC AGTCACGCGC GCTAGTGGAT GGGCGTCATA 720
TTGCCGCTAA TATTAGTACT GAGGGAATCT TCTGGGGCCT TGTTTACCTG GTAATTCTTA 780
TTTTAAATGA AGTACGTTTC ATTATCATTT ATTTCAGCAT TTCTGGAAAA AAAGTGCACT 840
GAAATCAAAC AACAACAAAA CATACAAAGA ACATTGTGGG CAGTTTGCAT ACTGAAAACA 900
GCTTCACAAC ATCCGAAACA CATAGAAACG AGCATTAAAT AAAATGAAAT ACAAACACCA 960
GCTTTGCTTG CATGTTTATT TAGGAAACAG CACATTTGGC ACACTTGAAT AGTTCTTTTT 1020
GTATTACTGT ATACTAAAAT ACAAATTAAA CAACATAACG TTGTATGAAC TGAAATTGTA 1080
GCCATATAAG GGCACAAAGT GAACATATTA ACGTACCATA TTAGCCTATA GGGATTGTTC 1140
GTTATTGTCA CCCTCCAATG TTTTTTTTTT CACAAAAGAA GATATTTTGA AGAATGTTGA 1200
GCAACAGTAA TCACT 1215