EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40368 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:9979955-9980272 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr6:9979980-9979993ACAACCACTTAAC+6.02
SOX21MA0866.1chr6:9979964-9979979AACAATTAAATTGTT+6.28
SOX21MA0866.1chr6:9979964-9979979AACAATTAAATTGTT-6.59
Sox11MA0869.1chr6:9979964-9979979AACAATTAAATTGTT+6.45
Sox11MA0869.1chr6:9979964-9979979AACAATTAAATTGTT-6.9
Sox1MA0870.1chr6:9979964-9979979AACAATTAAATTGTT+6.03
Enhancer Sequence
TTAATTCAAA ACAATTAAAT TGTTTACAAC CACTTAACGT AAAAAATGTA GTAAATCCAA 60
GGAATCATCT TTGAATAATT TTTTTCAGTG TACTAAATGT TTAGGGTTAG AATGTGGGGT 120
AGGTTTAGGG TTAGTTACAT GTAATTATGC GTAATTTATT GTATCGTAAT TACTAAAGTA 180
AGTGCATGGA ACATTTAACT GTCACCTTAA AATCAATTGT TACCTTACTA TTTTTGGGAA 240
ATTTAAAATA CATTGCTCTG GGTACGTTTC ATTTAGTTTC ACGTTGCATT TTAGATAACA 300
GGTCCACTAG AGGGTGC 317