EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40266 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:6225900-6226438 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXC11MA0651.1chr6:6226187-6226198GTTTTACGACC-6.14
HOXC12MA0906.1chr6:6226187-6226198GTTTTACGACC-6.14
HOXD10MA1506.1chr6:6226187-6226198GTTTTACGACC-6.62
HOXD12MA0873.1chr6:6226187-6226198GTTTTACGACC-6.02
Hoxa11MA0911.1chr6:6226186-6226198AGTTTTACGACC-6.74
MIXL1MA0662.1chr6:6225969-6225979GTTAATTAGA-6.02
POU1F1MA0784.1chr6:6225964-6225978AATATGTTAATTAG+6.88
POU1F1MA0784.1chr6:6226093-6226107AATATGCAAATTAG+8.42
POU2F1MA0785.1chr6:6226093-6226105AATATGCAAATT+7.22
POU2F2MA0507.1chr6:6226094-6226107ATATGCAAATTAG-7.04
POU3F1MA0786.1chr6:6226094-6226106ATATGCAAATTA+6.74
POU3F2MA0787.1chr6:6226094-6226106ATATGCAAATTA+6.74
POU3F3MA0788.1chr6:6225964-6225977AATATGTTAATTA+6.36
POU3F3MA0788.1chr6:6226093-6226106AATATGCAAATTA+6.92
POU5F1MA1115.1chr6:6226094-6226105ATATGCAAATT+6.62
Pou2f3MA0627.1chr6:6226092-6226108TAATATGCAAATTAGT+6.73
Enhancer Sequence
TATTTTTATA CAACATAAAG ATGTAGTTTT GAGTTGATTA TGCAATGACG ACATCGCGCA 60
AAGCAATATG TTAATTAGAA CCTATTTATA TCTGGGTGTA ATGTTTAAAT ATAATATAAT 120
ATAATACACT GCACTTTAGA GAGTAAAGAC ATGACGGGCT TACGCTTGCC AGATATTACA 180
AGATGACGTG ACTAATATGC AAATTAGTGC GTGGAAACTT TTCGGGCAGG CTTTAGCTTC 240
TTTTCAATGG AAATCTATAT GGGGCGTCTG CAGACTTGAT CCAGGCAGTT TTACGACCCA 300
CAATTTTACG GCCCTGTTCT TCCTAATGCG TCCAGTAGGG GAATGAAAGA TACATGGCCA 360
AATAATACAT TTGTCAAGTC AACGCTCCCA GATTATTAAA TGTCCTGTTC ATCAATTGTA 420
TATTTTTAAA TTAGATTACA TTAAATATGA ACGCTAAGTT AATGTATTAG AAAGTTATAT 480
ACACACTATT ATAATATGCA GAATTGATAC TCAACAAATA ATTTCAGATA TGCAAAAG 538