EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40200 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:4068527-4069614 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr6:4068978-4068989AGCTGTGATTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr6:4069452-4069466ATACATAATTAATC+6.02
POU4F2MA0683.1chr6:4069200-4069216CTTATTAATTATTTAA-6
POU4F3MA0791.1chr6:4069452-4069468ATACATAATTAATCAT+6.16
POU4F3MA0791.1chr6:4069200-4069216CTTATTAATTATTTAA-6.28
SOX8MA0868.2chr6:4069080-4069090AGAACAATGG+6.02
Enhancer Sequence
TCAGGACAAA ATGGTTTAAA AACTGTAATG ATTTAAATAT TTTTCGTGCA TATCAACTGT 60
ACGAAAAATT AGTAATTTCT ATCTTTTTTG TTAGAAAAAC CAATTTTACC TATAAACGTC 120
TCTGTCAGAT CAGAAAGGTA TGCTTTTTAG GGAGGGAGAT GATTGCTATT TTTAAAGAGC 180
ATAGTAATTC CTGATGTTAT AGCTTCCATA ACAATCGCGA ATTTATTTTG GACTTATTGG 240
TATGTTATAT GGAAAAATAA ATTCAAAGTA ATTAATAAAA AAAACTAATA CGTTATTCGC 300
GCCATGTCTT AGAGACTTTT ATTATGTAAA CGTTTCAGAC GTCAGGCGTG ACGCGTGATC 360
AGCTGGGACT GTGAAGAAAA GCTTTGGCAA GTCAACTTAC AAATGTTATT AAATATGAGA 420
GGCGCTGCAT ATGATTTGTC TTTAATAGTA CAGCTGTGAT TTGACCAAAG TGACTGTAAC 480
TGCCCAGAAC TGACGCTCGG CGGCAAAAAC GCGGCGGCAA AATCAATTTA CAGATGACCC 540
TCCATCAGCA TGCAGAACAA TGGTGAGATT CTGTTACATC TGGGCTTTGA TATTCCCGTC 600
ATATTCAGCA GATGATTGTT ATGCGTAATG TTATAAAGCA ATAGCTATTT TAGCATGCCC 660
ATATTAATTT TTCCTTATTA ATTATTTAAT AATGTAGTAC ACTCAGTAAA TGCATTAATA 720
CAACATTAAT CGAATTTAAA ACAGACATAT TTGATTTAAT GTTAAATTCT AGTTCATGTT 780
AGACTCTTAT AGTGCAACAT TTTTGTTTGT TGATTTTGTA TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 840
TATGTGTGTG TTTCTTAACC TTGTTAACCC GTGCAGTCAC TGTCAAGGAC TTGGAAAGGG 900
CACCAGCTTT CAGTTGCTCT TATAAATACA TAATTAATCA TTGGTTAACA TGCATGGTGT 960
TGCATATCTG TATGTTTGTT AAACCGCTGT ACAGTAGTAT ATATACATTT TAACTAACAT 1020
ATTTTAAACT AACATGTGCA TTAACAACAT ACATACATAC ATATTAACTA CAGAACAACA 1080
TGTAATG 1087