EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-40086 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr6:1021782-1022734 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr6:1021911-1021922TTAATTAATAT+6.62
JUNMA0488.1chr6:1022434-1022447ATTACATCATCTC+6.39
JUND(var.2)MA0492.1chr6:1022433-1022448GATTACATCATCTCA+6.23
LMX1BMA0703.2chr6:1021908-1021919GATTTAATTAA-6.02
NR2C2MA0504.1chr6:1022242-1022257TGATGTCAGAGGTCA-6.02
Enhancer Sequence
TGCACAAACG CATCCTGATG TGAAGTGACA GTCGTTTTAA AACGAGGACA CAGATGAAAT 60
ATTCAGTGCT GCTGGATGAC CGAGGGCTGA AATGTGCACA CCTGCTGGAT TCAGGTGAAA 120
TCTGCAGATT TAATTAATAT AACAACGTGT TATTTTTCAT CATGCATGCA TGCGTTCTGC 180
TGAAATTAAA TGCATGCTGT TTTTAAAAGC ATACTCTTAA TATGCTTTGC ATTGTAAATC 240
AACTTTTCGA GGAGATGAAT TGCACACATC TTGAGGCAAA GCCAAACTCT GGATATCTCT 300
GATGCAGCGC TGCTGTTTTC TTCTCTTTCT CCCGCTGTTC AACTTCTGTC CAGCTGCGTG 360
TCAGTCTGAG CTGCTTTATT TAGGGCCCGT AGCCTTTAAT TTAAAGTGCA CACACACACA 420
CACACACAAT AAAAATGAAG AAGCAGCACA TTGATGTCTC TGATGTCAGA GGTCAGAAAA 480
GTGTGCAGTT TTTCCATGCA ATGGAAAGTC TTTGCTTTAC AATACACATT CAGCCTGCGT 540
GCAATGACAG GAAGATCCGC TTCCTCCAGC CGCCGGCTGT CCTGAGATGC ACATTTTCAC 600
ACGTTTCCTA CAGCACAAAG AGCAGCTCCT CGCCGTGCAT GCGTTCAGAT TGATTACATC 660
ATCTCAGGTT TGCAAAAGGA GAAGTCTCAG TGTTTGATTA TGGCAGCTGA GCCGTCGCTG 720
CTGAATTAGG AGGGGGGCGA CTCTTTGGCT CGGGCTCTTT CATCCCCAAC AATAGCAGAT 780
TCCGCCCCGT CTAAACTGTT TCTGCGCCCC CATTATGCTG CGCGGCTCCT CCTCTGCCTC 840
CTGTGTTTGG GAGGAGCGGG GCCCGGCGTG CGCACAGCTG ATTGTCAGCT CTAATACGTG 900
TCATTTACAT GTGCGCAAGG TGAGCGGAGC GTGAGCACCT TCAGTTCCTC TG 952