EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-39976 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:71116299-71118079 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr5:71117417-71117436TGGTGCCATCTGCTGGACA-7.63
FOXK2MA1103.1chr5:71117527-71117538ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr5:71117527-71117538ATGTAAACAAA+6.14
KLF16MA0741.1chr5:71117552-71117563GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr5:71117552-71117562GCCCCGCCCC+6.02
NEUROD1MA1109.1chr5:71116911-71116924GTGCCATCTGTTC-6.82
NR2C2MA0504.1chr5:71117448-71117463AGGGGTCAAAGGTTA+6.84
Nr2f6MA0677.1chr5:71117449-71117463GGGGTCAAAGGTTA+6.95
RFX1MA0509.2chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr5:71116416-71116432AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RXRBMA0855.1chr5:71117449-71117463GGGGTCAAAGGTTA+7.17
RXRGMA0856.1chr5:71117449-71117463GGGGTCAAAGGTTA+7.22
RxraMA0512.2chr5:71117449-71117463GGGGTCAAAGGTTA+7.19
SP1MA0079.4chr5:71117549-71117564AAAGCCCCGCCCCCT+6.67
SP2MA0516.2chr5:71117548-71117565TAAAGCCCCGCCCCCTA+6.9
SP4MA0685.1chr5:71117549-71117566AAAGCCCCGCCCCCTAA+6.74
Enhancer Sequence
TGTGGGTGGC GGGTGGAAGA TTGCTATGAA GATTCGGGTG ACATTTCAGC TGATCCGCGC 60
ATCTCTAGTT GCTATGGTCA CACAGCAACT ACTTTTGATA TGTCATGGTG ATTATACAGT 120
TGCTATGGTA ACACAGCAAC TATAGTAACA AACAAATCAG CCAATACTGT CGTATTCTAC 180
AACTATAGAG TCTGCTTTAT TATAATACCC GACGGTTTAC TGTAGTAAAA ACTAAAGTAT 240
GCTACTGTAT TTGTTTTAGT TTATCAGTTC ACTATAGTTA CTGTAATACT ACAGTATGCT 300
GGAGCATTCA TTAATATACT AGAATATATA ATATAATACA CTTTAGTATA GTGCGTTTCA 360
TACTATAGTT GACTTATTTA TTCAGTTGTG TGTGATTTAC TGGTATATTT ATTATAGTAA 420
TGATCAAATG TACTGCACAT TACACGGTAA ATTTACTCTG CAATACTGTA GTAAGGCTTT 480
CTCTGCTTGT GATCATGCAG TAGTATTGTG CATATGCTTG CTCTGCCTGT GATTTCCTCA 540
TTTCTATGCA TCTGTAGAGA AACTCTGCGT CACTGTGAAT AAACTGCACA TCTTGTCCAA 600
ACACTGCTCT CTGTGCCATC TGTTCACGGA TGTAAATCAC GCCGTTCACG CGCATCTCTT 660
CCACACCGCA GCCAAAAGTG TGTCTTTCAC CTCTAAATCA CACACGCAGA TTCATGGCCG 720
TGTGTGTATT AATGCAGAAA TATGCTCGTA TGCAGAATCC AGTGACTCAC AGCATGAGTT 780
CACTGAATAA AACACATAAA CACACGCACA CTTAATATAT ACAGATAGCC AACGCTGTAA 840
AGTAATGCAT TTCAACTACT GTAAAATACC TTAAGCGAGT ACTGTTTCTC AGACACTTTT 900
TAAGTAAGAC ACTAGTGAGT ATGTTTTTAA CATGTGTACT TTTACTGCAG TCCATTTTTA 960
GGGATCTATA TGTACTTTAT CTGTACTGTA ACCACTGTCA CTGCTTTACA TGTTGATTTA 1020
TTCTTGTCTT CAGTGATTGG AAGAGTGGAA TAATCCGTCC AATCAAATCA CGCATAGAAA 1080
AATGAGTGCT TTATCAGTGC TTTAGGAGTT TGGTTTTGTG GTGCCATCTG CTGGACACAT 1140
TTGTTAATCA GGGGTCAAAG GTTATAACCC GAATATTAGC ATATCAGCAC AGCTAGATTT 1200
TCCCCATTTG ATGTCACAAC AGACTGGCAT GTAAACAAAT AACCCTGCTT AAAGCCCCGC 1260
CCCCTAATCA ATATTCACTC TCAGCTGTAA ATACATCAAC ATGCTGAAAT AAAAGTCTGG 1320
TGGTGTGTTG TGCTCAGGCT CCAGTGTGTG TTTCTTGTTG GATGTGCAGC TCAGACAGAC 1380
TCAGATAGTG AGTTGATGTG CTGATCCTCC GTCTGCGGAT GCTTAATCTG ATCCCAAACA 1440
AACCCTTCAC AGCCTTATGC CGCAGATTAA CACTCCCTCC TAATCTCACA CACTTTCTCA 1500
ATCGCAGGGA ACTGCCAGAG TGTTCTGCAG AGAGACGATA AAATGAGTGT GCTTGATTTT 1560
ATATCCCAGT TAGGACTCAC ACCTGGATGC ACACAGACTC ATGGGGACTT GTATCACCTA 1620
TGAGGACCAA ATTTGGGGGT CTTAACTGGT AAATATGCTC ATAAATCAGA CAGAATGGAG 1680
AATTTTAAAG AGGTCAAAAT GCAGATTGTT TCCTGTGAGG GTTAGGTTTA GGGTTGGGGG 1740
ACGGGGACAG AATATATGGT TTGTATTGTA GAAACATCAT 1780