EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-39920 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:68498449-68499695 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr5:68499652-68499663GGCAATAAAAC+6.32
CDX4MA1473.1chr5:68499652-68499663GGCAATAAAAC+6.62
HOXD9MA0913.2chr5:68499653-68499663GCAATAAAAC+6.02
Enhancer Sequence
CAAACACACA CACACACACA TACACACAAA CTGACTAATT TCCCATGCAT ATGTTAATAA 60
CCGCAAACAT TTGAGTAGTC TCAAGGCAAA AAAAGCAACA TGTAAACACT AAATGCACTT 120
TGAATTATAC AGGATAATAT AATGTAAACA CTGCACGCTA TGACAGTAAT CATAACAATG 180
TATTAATCAC TGATTTGTGC ATGCACAAAA TCCACTTTTA AGCCATTTCA GCGCTTGCAT 240
TAGTACATTT CTTACCCAAT TTCCTCGATA AGCACAGGCA GCAGAGAACT GATGGTATTT 300
TGAAAGGAGA TCCGATGTGC ACCGCTGGAA ACCAGGCTTA CTGATACAGA AATTCGCGTT 360
CAGGCATCAA AATATCTCAT CATCATGCGA CAATATTGCT TGATGTTATT GATGTAAAAA 420
CGCGTTCACA CTAACAGACA CATTAGAGCT CGTGTTCCTC TAACAGAGAA GGACCTTGAG 480
GTTTAAAGAC GCTGGCGTCG CTGGAGGCAG GTGCATTTCA TGTGCAGATG TGTGGCGGGG 540
TCTTTGCGTG TATTTGATCC GCAGAGAGTG CGAGGCGAGC GGTCACTGCT GTCCTTCAGC 600
GCCGCTGCTC CGCTTCATTA TTGCAGAAGA GCTGCTGGCG GTGCTTTCGT CAGAGATTTA 660
ATCGGCACGT AACGCTCCTG TCACATGGTG TTCCGCCGAA GCTAACATAT ATGTGTGTAT 720
TATATTTGCA TTTCCAACAG CTCGAGCTTG CCAGCCACCA AAGCGCTTTA GCAGTTAGCA 780
TGTGCTTCTC GGCGTTATTT CTGTGTAAAT GAAATGCCGC ATGAGAACGC GGTGTCGTTG 840
TCATGACAAT CAGCGCGTAT CTTTTTTATT ATTTTTTTTA CACTTATAGA CTTTATTATA 900
TCAAAGCGTG TAAAATACAG CACATTAAAG GTATTAAAAC TGAATGAAAG CAGTAAAATA 960
GACACAATCA CAATATTAAG ATACTGAAAA ATGCTGGATT CTGCTGATAA ACCAGCATAT 1020
GCTGGTAAGG TATGCTGGTC TAAATTTGGG CCATGACCAG CACTGAGATC AGCATTGAAA 1080
CCAGCACATT GACCAGCATC GAAACCAGCC TTTAGACTAT TAAAAACCAG CAAGACCAGC 1140
ACTGAGACCT GCATTAAAAC CAGCAAGACC AGCTTTGAAG CCAGTAAGAC CAGCACTGAG 1200
ACCGGCAATA AAACTAGCAA GACCAGCACT GAGGCATTAA AACCAG 1246