EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-39743 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:63887451-63888756 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr5:63888294-63888305ATGTTTACATA-6.14
FOXC1MA0032.2chr5:63888294-63888305ATGTTTACATA-6.32
FOXK2MA1103.1chr5:63888293-63888304CATGTTTACAT-6.14
IRF1MA0050.2chr5:63888602-63888623TGCTACTTTCACTTTTCATAG+6.13
PBX2MA1113.1chr5:63888525-63888537GCTGTCAATCAA-6.32
POU3F1MA0786.1chr5:63888251-63888263TTATGCTAATTT+6.37
POU3F2MA0787.1chr5:63888251-63888263TTATGCTAATTT+6.22
POU3F3MA0788.1chr5:63888250-63888263TTTATGCTAATTT+6.87
POU4F1MA0790.1chr5:63887843-63887857CATTAATTATTCAT-8.42
POU4F2MA0683.1chr5:63887841-63887857ATCATTAATTATTCAT-7.84
POU4F3MA0791.1chr5:63887841-63887857ATCATTAATTATTCAT-8.35
Enhancer Sequence
ATGGGGGGGC GCCATTGTGC CAAAACTATT TTTGAAATTA TACATATTAT TATACATATT 60
AAACAAAATA AATACATATT TTTGGTTAAA AATGTTTATC CTGCATTTTA TATAAATATT 120
CAATTGTATT TTATTGAATA AAAAAATTAT ACCACCCCTT CCTCTTCATT GACCATTTGA 180
TTGATCCGTT GCTTGGTTAC AGTCACATGT TCAAAATGGA GAGAAGAGTA AAGAGACGTG 240
GAGCGCAAAA TAGAAAAACA AAAAGAACAC AAACAATGCC TTAAAAAAAC TGCCACGACA 300
AATTGGATAA TAAGGAATTG GTAAGCTTAA GCTTAATATT ACCACACTTT TAATCAACTT 360
GTAATGTTTT TGGGAGCGAC GGGCTGCCAT ATCATTAATT ATTCATTATC GCCACTCAGT 420
CACTGCATGG GCTTTTACTT AACGTAAATG CAGACAAGGT GGTTTTGTCC AGGCAGGGGA 480
CAGTGACGCA CGGCCACACC TGAACAGCGT CCGAAATCGC ATATTTGCAT CCTGTATAGT 540
ATGCGAAAAA CACTATAATT CTATGGGCTA AAGCCATGAT GAGCTGGTGT AAAGTTAACT 600
TTATGGTAAA GGCTTTTGAC AGTCGTAAAT TCATGGACCG TCAGCTTCAA AAGAGAACAT 660
TTTTATTTAC TGCATTTAAA TATTGATTAC AGTTGCTATA GTTTAAAGAG CAACAAATGA 720
ATTTAGTTTG ATCCTCTGTT TTGTTTGATA ACAGAGGTGC GAGTCTGACT TTAAGAATGC 780
AATGAAAACA TTTGTTTTGT TTATGCTAAT TTAAGATAAT ATTACTTGTG TTTCAAATAA 840
AACATGTTTA CATATTATTG TGTATATTTT TTCTATTTAC ACACCTGAAT CTTAAAGTAT 900
CCGCTCTCAT TCATCTTCAA ATCGCGTGTA TAAAAGCCGT CTTTATCACT ATGGAGCGCC 960
TCCGTCACTC AGCACCGTTC TACTGATTCA GAGGCTGCAT AAGGGCGGCA AAAGACGCAT 1020
AAAGCTTTAC TGGAAAGGAC GTGAATGCGG CCGTTTTTAC ATTAATTTTA ACGTGCTGTC 1080
AATCAAAATA ATGTGAAAGC TTAGTTCTCT TTAACAGTTT TGCATCACAT TTGAGATCGG 1140
CTCTGTGCAG CTGCTACTTT CACTTTTCAT AGAAACATTA CAAATGCGGG AGAAATACTG 1200
GAAAAACACA CACGAAAGAC AGCGGATAGA ATGGTAAAAT ATGGTAGAAT TAATATGGCA 1260
AAAACGAGAG GATTTGTAGG TATGAATTGC ATTCGTTGGC ACATA 1305