EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-39662 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:61444692-61445670 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr5:61444948-61444959AGCTGTGATTT-6.14
Lhx3MA0135.1chr5:61445531-61445544GATTAATTAATTA-7.34
NR2F2MA1111.1chr5:61445060-61445071TTTGACCTTTA-6.32
POU4F2MA0683.1chr5:61445533-61445549TTAATTAATTATGGAT-6.37
POU4F3MA0791.1chr5:61445533-61445549TTAATTAATTATGGAT-6.19
POU6F1MA0628.1chr5:61445532-61445542ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:61445532-61445542ATTAATTAAT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr5:61445449-61445465AGTGATTTGCATAAAA-6.09
ZNF384MA1125.1chr5:61445461-61445473AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr5:61445462-61445474AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr5:61445459-61445471ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr5:61445460-61445472TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GTTTTAAGGA TGTCTATAAG CTAGTGTGCT CCAAAACAGT GACAAAATTC AAATTAAGAA 60
AATATAAAAC TGATTTAAAT ATCCAAAGCT TGTAGTTTGT CAACGGTTTA ATTCACGTCG 120
CCTCATACTA AATAGTTTCT TATTAAATCT TAACCAATCA AATGCTCTAT AGTATCTGAC 180
ATACCCCGCC CTCTTCAAGA CGCCTCTCAT TTGCTTTTCT TTTGATGTGC TTAGGCTCAA 240
CCACTCTCAC TGGCTGAGCT GTGATTTAAA AACAAAACAA TTTTGGCCGT TTTTAAAGGG 300
GAGGAGCAAC ACTGTCCCGC CCTCTCTTCA TTTTTTCGGT TGAGATTGTC ATGCATCGAG 360
TTAAAAAATT TGACCTTTAA CTAGTAATAC AGCCATCTTC ATTTGTTTGC ATCACATTTA 420
AACAAATTCA GCAGATTTTC CTTGTAAATT AACACAGAAA ATGAAAAACC TGATTCTATC 480
TGGGCCTGCC AGTGGGTCTG GAGAATGAAG CTCTTCCTTT ATTGAGTTTG GATCAAACGC 540
GTCACATTAC ATTTTCACTC GCATTAAAAG TGCAAGGAGT TTTTTTTCCA GAACATCCTC 600
TTAGCATGAC AAAGCACTGG GATGTTTCCC CCTCAACAAA GGGTCAGTGT AGTGTTACCT 660
TTTGACTTGG CTGAATGGGA CGAGTCTCCC TAATCTGGAA TGTTGTGGGA AATTTCAGGC 720
AACCGTGCCT TCAAACAAAA ACACTGAAAC CCAATTCAGT GATTTGCATA AAAAAAAAAA 780
AACGTCCAAG AGGGTAAAAA AACAATAATT TAGTCACACT ATCGGCTATG GGGGAAAGGG 840
ATTAATTAAT TATGGATCAC AATTCTTCTC CTCTCGCTTC CCTCACTTTT AATTGCAGAA 900
GCATTTGGAC TTTGGCGGTA ATTATGTGGT AATTATCACG GATAGATTGC AAACATTTGA 960
TGCTGGATCC CATCAGGC 978