EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-39439 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:53980109-53980828 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr5:53980642-53980657AGTTAATGATTACCC-6.07
HNF1AMA0046.2chr5:53980642-53980657AGTTAATGATTACCC+6.12
HNF1BMA0153.2chr5:53980643-53980656GTTAATGATTACC+6.03
POU1F1MA0784.1chr5:53980591-53980605AATATGCAAATAAG+6.92
POU2F1MA0785.1chr5:53980591-53980603AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr5:53980592-53980605ATATGCAAATAAG-6.57
POU3F3MA0788.1chr5:53980591-53980604AATATGCAAATAA+6.04
POU5F1MA1115.1chr5:53980592-53980603ATATGCAAATA+6.02
SOX10MA0442.2chr5:53980457-53980468GTCTTTGTTTT-6.14
SOX13MA1120.1chr5:53980809-53980820GGCCATTGTTT-6.02
Sox6MA0515.1chr5:53980811-53980821CCATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
ATCCAGCGGT ACATCCGAGA TGGACTGGCC AAAGTAAAGC TGCTCTAAGC GGGGGAGGTG 60
ATGACGAAGC TCCCTTTGGT AAGCTGGGAG TCAGAGTCTG TTGTGCTGTG AGGAGTTCTT 120
GTCTTTAATA AACTACGGCA GTTTGCGTTC ACTGAACAGT AAGAATGATT AATAAAACGA 180
TTACATTCTC GCTTGAAAAC TTTTAAAACT TTATTTTGTG ACACAGTGAA GGAGTATTTT 240
TAAAACCATG CGGGTTTTCT CCTCCACCAT TAGCGATTGC TGGTTTAGCT GCAATGAAGG 300
AAGTTTAAAG AAATATTTGC ATGCATGGCA TCTTGTTTTC ATTCCTTTGT CTTTGTTTTC 360
CTGCCTTTAT GCATCTAATG AGGCTTAAAA CTACCTATGA AGTGTTTTTT AAATAACTGG 420
CAAGACAAAA GAAAAGCCAC GTAGATGGGT TGTTTACTGT TTGTAAAATC AGGGACATTG 480
CAAATATGCA AATAAGAACT TTAAGCCATG GTTAATGTAC AACATGAAAC ACTAGTTAAT 540
GATTACCCAC GATTACCAGT TAACCCCAGG TATGGTATGC AGTATGAAAT CTGAATACAG 600
ATAAGCCAGG ATTCTGCTTA CCCATGGTTT AAATGACCCA GGCTTAGTAA ATTCAAGTTA 660
ACAAAAATTA TAAAAAGTTC CATAGTGTAG GCTTGTTACT GGCCATTGTT TTAATATAC 719