EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-39269 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:51341167-51343405 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr5:51342553-51342565AAACAAATAATC-6.07
GFI1MA0038.2chr5:51342218-51342230TGCAGTGATTTA-6.92
HLFMA0043.2chr5:51341445-51341457CATTACATAACA+6.32
IKZF1MA1508.1chr5:51342497-51342509AAAACAGGAAAT+6.11
MNX1MA0707.1chr5:51343199-51343209TTTAATTACC-6.02
RFX1MA0509.2chr5:51342819-51342835AGTAGCCATAGTAACA+6.05
RFX1MA0509.2chr5:51342819-51342835AGTAGCCATAGTAACA-6.05
RFX2MA0600.2chr5:51342819-51342835AGTAGCCATAGTAACA-6.09
RFX2MA0600.2chr5:51342819-51342835AGTAGCCATAGTAACA+6.16
RFX3MA0798.1chr5:51342819-51342835AGTAGCCATAGTAACA+6.15
RFX4MA0799.1chr5:51342819-51342835AGTAGCCATAGTAACA+6.06
RFX4MA0799.1chr5:51342819-51342835AGTAGCCATAGTAACA-6.33
Enhancer Sequence
TCATGAGACA CAAATTTCAG AATGTATTAG TTAATGTTTA TTCTGAGTAA TGTTTTGAAA 60
TCATTTTATT GTATTCAAAG CAACATTTAG GAATGTGAAA ACTTGATATT ACTTTCAATC 120
TTCACTTTGC GATGTTTACT ACAGTCAAGG CTGAAATTTT TCATACCCCA GGGGGAACAC 180
TTTGCATGTC AAAACTGATA ATGAGAATAA AGTGTCTAGG TCTATAACAT AGCCCATATG 240
AGTTGATCAG AAATAAAAGA AATCAATTGT TTTTTAGTCA TTACATAACA TAGCTTATCC 300
TTAAAGTGTG TTAAATTGAT CTGGGACTTT TAATAAAAAA TGTTTATATT TTTGTAAATC 360
ATGAAAATTG TGCTAGCTTT TGCAGTATTA AACTAAAAGT TCAGAGAAAG CAAAGACCAC 420
CCCATAGACA GAAAAGTGGA TGAAAATGAA CAAACTCTTA TATCCGTTTG CCATTTACTT 480
TTATTTATTT ATTTTTTTTC AGCTGATGGC CCGCAATGTG CCCCCCACTT TGAGAATCAC 540
TGTGTTAAAG GGAGAAAACA GGGCCTCTGT GACAAGACAA AGATCAGAGG AATCACAGCA 600
ACAATCTCCA ACAATCAGAA GAACGCTTCC CCCTCTCCAG ACAACAGGTG GTCAACATGT 660
ACGAACCCAA CCCATTCCTC CACCGCACCA TGATCAACCC TAGGGGAGCA GGACACAAAC 720
AAACCATCCC CCATCCCCTG CCCCGGAGAC ACTTCTCAAC CCCCTAAAAA GAGCCCTTTT 780
TTAACCCTCT CCCGCAACCA GCAGGGGTCT GGGTGAAAGG TGACGATCCC TGAGTGAGGA 840
CAATAACCTG GACATTGTTT TCCTAACAAT GGCTTGGGAA TTTCTCGAGC TCATCATCAG 900
AAAGCATGTG GAGGGGTTTG AAGAATGTGG TGGTATAGCA AGCAGATTTG TGTCTGCTCT 960
GAAAGCTATT AGAGAACTGC TGGGTGCTAA AAAAAAAACA ACACTTATAT TTATTTCCTA 1020
GAACAAAACA TCAGCAAGTC AGCCCAGGTT GTGCAGTGAT TTAGAAGTCT GCAAACACAG 1080
TCTGCTGTGT ACCTTTCAGT ACTAACTAAA GCTCTTGCTA GATTAAAGCC TTATTATCTC 1140
CACAGTGTAG AAAGCATCGA AAAACTGAAC AAAAAAAATA CTGACTTCTG GGTTCTATGG 1200
TAGCCACACT CTAAAAACCG CTGTGTAGTT GTAATCCAAA GTTGAGTCAA ATGTGGAAAG 1260
ATTCAGCCAA CATTCTGACC CAGCATTAGG CTACAACAAC CTAGTATTTT TTGAGTGATT 1320
GTATGCTTCT AAAACAGGAA ATGAAAAAAT ACAATGAGCC ACTTGACACT ATGACACTTG 1380
ATAGTCAAAC AAATAATCAG ATTGAGTTTA AAGCGATCCT GGTTAATGTT ACAAATGGCC 1440
AAGAGCATAA AAACATAGCT ATACTGATAT ATTTCACTGA GCTCAAGTAC TATCAGTTTC 1500
GAAACTCGTC AGACAATTAT CCTATAGTCT CCATGTCATG AATAGCTGCT TTGTGGGTCT 1560
GCTTGCCAGG CAATTGTACA GCTGAGGCAA AAATGTATTA CTTCACTGTT TGAAGTGTAC 1620
ACAAAAAAAG TGCTCTTTTG TGAGATGGGA ACAGTAGCCA TAGTAACACC GAAGTGTCGA 1680
ACCTTCCCTA CTATAATTGC ACTGCACTGA ACGTTGATGG ATGGATGGCG ATCGCTTGAC 1740
AGCTTTTTCA GTTGCAAATA CAGAGTCATC CAAAGGCTCA AGGGACAAGA GTAAACAACC 1800
TCTAAAATGG TAATTGGAGA GTAAAAGAGA TGCGTAAAAG CTGTGTGAAA TTCACAAGGG 1860
TGAGAATGTC TCACTACTAC GCACAAAGTC AACACAGATA GTCCTGGCAC AAATGCCACC 1920
TTTCAGCTGT AGAGAAAAGT CACTAGCTGA GGTATGTGTA AAAATTCACA AATGTCCTTT 1980
AGCTCAAATG GTAGAGCATG ACAATAACAA TGGTCACCGG CAAGGCTGTG AGTTTAATTA 2040
CCAGGTAAAA CAAGATGAAG CTCATAAAAT GTGTTAAATG TGCAATAAAA AGTTCCTTTT 2100
TGAATAAAAA AGTATTTGGA CACAACCCCT AAACGCAGAG ATTTTCAAAT ATAGGGTGTA 2160
AATGTATGGT GTATTGTATG ATTTTAAAAT AATTGAAGGA AACACACACT ATCTACTATC 2220
AATAATTATT TATTAAAC 2238