EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-38933 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:42618259-42620120 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr5:42618455-42618472CAAAAATAAACAAAACT+6.32
Foxj3MA0851.1chr5:42619678-42619695CAAAAATAAACAAAACT+6.32
HNF4A(var.2)MA1494.1chr5:42618857-42618872TTGCCCTTTGGACTG-6.19
HNF4A(var.2)MA1494.1chr5:42620080-42620095TTGCCCTTTGGACTG-6.19
Enhancer Sequence
AATTGTGAAG AGAGGGAGAA AAAGACACAC AGATCCAAGA TTGCTGCGCT TTAGAGAATG 60
AGCTAAGAGC AACTTCATTT GATCGCCGGA TTGATAACAA CCATTCTGTC TAGGCTAATC 120
TACTGACACA AACACTCTTC CACATCTCGT TCTGCAATTC AACATCTTAA TGCAGCTCTG 180
CAGATAGCAG AGCACCCAAA AATAAACAAA ACTCACAATA GTTCCTCCCC ACGGAAATCT 240
TTAGTAAAAG GCGAAAGATT TGTGCGTGAT TGAAGAGAAA CTCGAGCTGT AACACTATGC 300
TGCTTAATCA GAGCAGTAGG CCTGACACAG CACAATGTTC GGCAAGGGTG ACTGCAAGGC 360
ACGTTGGCCT CGTAATCATA CTTTGTTGAA AGGAAGGCAT CGAAGCATTA CGCAGTACAG 420
AATGAGGTCA CACAGAAAGA GGTGCAGTCT TTGGATAAGA CAAATATATC CACATTTTCA 480
AAGCTGCAGT GATGTCACCA TGTAATATTG TGTTATTAGG ACATAAGACA GATTAGAGCC 540
CAGTCCTTGG TAACAGCCAA AGGTTTTGAG GGTGACTATA ACCAGCAGAA GCTACAGTTT 600
GCCCTTTGGA CTGAACCCAT CGGTCGTTGT TTTTATTACA TGTCTGACTC TGCCTGTCTT 660
AAGGAGGAAT GGCTTGGCTT CGGTTTGGTG AGACTGCTAG CAGAAAGTGT CCACCCACGC 720
TTGACATAAC CAAAAGCACG CTAGTCTTTA TTAGTATAGT GGACAGTATT TCCATGTGTC 780
ACCCGGATGA TCAGGGTTCG CTTCCCTGCC AGGGGGGGCT TTTTTTAGGA TGCTAAACTC 840
CTCTTAAAAA CTTGAGCTTC AGCATGAATC TGTCCAAAAA AAAAACAAGC CCACAGTGCG 900
ACGTTCGTCG GAAGAAACTT GCAGCCTTTT GCTCTCAGGC ACCCTCAACA TAATAGTGCA 960
GCTGAACAGT TTACATTCTT GCATAAGTGA TCCTCGTTAG TATAGTGGAC AGTATCTCCG 1020
CCTGTCACGC GGAAGACTGG GGTTCGATTC CCCGACGGAG AGGCATTTTC TTCAAGACGC 1080
TGAACTCCTT ACCCCACCTC AGGCTTAAGC ATAAAGCTGT CCAAAGAAAC AAACCCACCA 1140
TACAATATTG GCCATGTCCT TCTTGTGGTA AATAAGAGCT GGATTTTGCT CACTCGCTTT 1200
TTTGCTGCGG TTCCAAAGAC TGCAATTGTG AAGAGAGGGA GAAAAAGACA CACAGATCCA 1260
AGATTGCTGC GCTTTAGAGA ATGAGCTAAG AGCAACTTCA TTTGATCGCC GGATTGATAA 1320
CAACCATTCT GTCTAGGCTA ATCTACTGAC ACAAACACTC TTCCACATCT CGTTCTGCAA 1380
TTCAACATCT TAATGCAGCT CTGCAGATAG CAGAGCACCC AAAAATAAAC AAAACTCACA 1440
ATAGTTCCTC CCCACGGAAA TCTTTAGTAA AAGGCGAAAG ATTTGTGCGT GATTGAAGAG 1500
AAACTCGAGC TGTAACACTA TGCTGCTTAA TCAGAGCAGT AGGCCTGACA CAGCACAATG 1560
TTCGGCAAGG GTGACTGCAA GGCACGTTGG CCTCGTAATC ATACTTTGTT GAAAGGAAGG 1620
CATCGAAGCA TTACGCAGTA CAGAATGAGG TCACACAGAA AGAGGTGCAG TCTTTGGTTA 1680
AGACAAATAT ATCCACATTT TCAAAGCTGC AGTGATGTCA CCATGTAAAA TTGTGTTATT 1740
AGGACATCAG ACAGATTAGA GCCCAGTCCT TGGTAACAGC CAAAGGTTTT GAGGGTGACT 1800
ATAACCAGCA GAAGCTACAG TTTGCCCTTT GGACTGAACC CATCGGTCGT TGTTTTTATT 1860
A 1861