EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-38892 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:42021739-42023033 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr5:42022084-42022096GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr5:42022088-42022100GTTTGTTTGTTT+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:42022378-42022389TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr5:42022378-42022389TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:42022378-42022389TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:42022378-42022389TAATTTAATTA+6.62
RELAMA0107.1chr5:42022583-42022593GGGAATTTCC+6.02
Enhancer Sequence
AGAAGCAGAG GCCGGTTCCA TTGAGGCTGT GGGTAAAGCT AAAGCAGAGA AGATGAGGCT 60
CAAACCTGAG GACTATCAGC AGTACGGGGA GGCAGCAAAA ACCACAAATG CCCTGGAGGC 120
TCTGCCAAAG GTCTGTGGAA CTCTTCAAAT CTACAAATCA GACTGACATT ACACATGCAC 180
CCTTTTTCCT ACTTTGTTTA AGGAGATAGA ACGGGGAATT AGACAGATAA ATGGTACAAG 240
AAAGTAAGGC AGTCGTTGTT TATAAGATAT TTGCCAGATT TAAAATCAAA TCAGTTCTGT 300
TGAAGTCAGT TTCAAACACT TTTCCAATAA GATGCCAACG AGAGTGTTTG TTTGTTTGTT 360
TGCTGTCCCA AAAGTCATTT TAAGAAAACA TTAAGGCCCA ATTCTATTTC TACTTCTTAG 420
CTCTTCCCCT TACTCCTCAT TTTGCGTGTT CACATGAAGG GGAAAGGTTG TCCCAATTCT 480
CTTTAGCTTG AAGGCGTTGG GCTAGCAGGA AGGGCTAGAT ACCCCTTGAG ATTTTTCAGG 540
GCCACTCTTG AAATCAATGG GGCAGGGGCG TAGATTTAGG GTGGACGGTG GGGACGTGTC 600
CCCACCAATA TCCACAAACT ACCGAAATGT CCCCACCAAT AATTTAATTA TTACTTAAAA 660
ACATCGCGCT GTCAGTATAA ACCTAGACAT GCCGAAAGGG TTAAATCAAG TTCTCTCCTC 720
GAGTCGCACC GCCCCCAAAC ACATATGAAC ATTGTGATTG GCTGTGCCTT TTCCTGCTGT 780
CATGTGAGTG GCTGCTTTCA GATCATAGTT TCAGATACAA ACAGCGCCAA AACAACTGCG 840
CGGGGGGAAT TTCCCGATGT GTGAGATGTG TGACACGCAC AAGGGAGGAT GGAGGTAGCA 900
AGAAGAGCTG GATATAAAGA GCTTTTTCCA ACGAAAAGTG TAAGTCACAT AAACTCAAGT 960
TCGCTACTGA ATGAGTCCAT CATGATAATG CCGTTATGCT AGTGTTTTCA CCGCTTTTAC 1020
GTTCAGTCTA ACGTTAAAAC AGACTAACGT TAGTCTGTAA ACAATATTCC CTGAACACTA 1080
ACTGCAGAAT AAACACCCAC ATGTAAACAT ATATGACCCT GCCAGTTCTC CTAATCTCTT 1140
AGAGACTCCA ATTTTGGTTG AAACAATTTG TCAGAAAAAC TACAGCCTGT GCTCCATCTT 1200
TTAATAATAC TATGAGACAT GTTTAATTTG TACGAAAAAT GAACTAAAGT CTTTATTAAA 1260
CTCTCTCTTT ATTCGTTAAT AAACACTATT TTAA 1294