EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-38840 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:40893711-40894859 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr5:40894362-40894375AAATTAATTAAAT+6.07
Lhx3MA0135.1chr5:40894793-40894806GATTAATTAATTT-7.82
POU6F1MA0628.1chr5:40894794-40894804ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:40894794-40894804ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TTTGTTGCAT TCAAATTGTA CAGCTTAAAA TTGCAACCAT TTCTAATACG TATTATGCTT 60
TAAACCCTAA CAGTAATAGC TGACTTAAGT GCTGTTTTCT CAAATATGTA TCTTAACTCG 120
TATAAGAGTG TGCAGTGAAG CACAGCGTGT ACCATGAGTG CGCACTTTCT GTACTGCAGT 180
CTCCTCAGCT CAGGCGCTGC CCAGAGATAC ACTCAGCCAA TAACACGCTT CTCGGGCCTG 240
ATTAAGAAGT GCTTAGTTGT CTGGTCACTC AAAAACAACA ACATCGCGGC CCCTTCACTT 300
TAATAACTCT ATTTGCACCC AGCATCCCTC CACAGTCATG GCTTTCTCGG TGTCTGCGCA 360
TGAAACTTTA ATACGCGCAC AGAACAGCAC GGTGGGCGTG AACGCGCTAT TTATAACGGG 420
GCAACGTTAT TCCAGTGTGC AGCCATAACC CTAAAATAGC TTACTTTCAC TTAAAAACAA 480
AGATCGACCA AACCGCGTGT GGTTATTCGT TTCATGTCTC CGCAGTACGG CTGTCACACG 540
ACGAACTAAA TGAAATCGCG ACTAATCCGG TATAATTTGT TTTAGGATAA AATGACGTCT 600
ATTTCAATAA GGTTACGTCA TTCTCGTTCC CTATTTTATA ACGACGACGT GAAATTAATT 660
AAATGTAAAA GAGACAATTC AAGTTCAGTG TTCACCAGAA TCTTCTTTAA GCAGGTTGTC 720
GTTACGTCAC AGACAGAGGA ATAAAATGAG ATTACATAAA CGACTGAAGA CGTCCGTCCT 780
AAATGTACGA GGGTGTTTTA AAATAACATT TAGGACATTT TTAACGCAGC CTGGTGAAAT 840
GACACGGTAA AATAACGTAC CATTTTGGCG AATGGCTCCC AAGTGTAGGA CGGCCTCGCG 900
TTGCGGTCGC TGCTCCTCTC CGCTGGAGGA CTTGGGGGGG AAAGAGAGAG AAGATGACGT 960
CGAGTCTGAG TTTATGCTGC GACAGTCTGA CGGACAGCAC TGCGGAGTCA TGTGGAAGAG 1020
TCATATGGAC CTGCGGGACC CTATTACTGG ACAGACCGGT CCCACTGTAG GGATTAAGAA 1080
AAGATTAATT AATTTTTTTA TTCTAATAAT AAAGTTAAGT AATTGTTCTC ATTTTTTGTT 1140
GCATTGTC 1148