EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-38589 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:35733009-35735451 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HESX1MA0894.1chr5:35733204-35733214GCTAATTGGC+6.02
LBX2MA0699.1chr5:35733204-35733214GCTAATTGGC-6.02
Nr2f6MA0677.1chr5:35735226-35735240TAACCTTTAACCTC-6.06
RXRGMA0856.1chr5:35735226-35735240TAACCTTTAACCTC-6.3
Rarg(var.2)MA0860.1chr5:35733868-35733885TGACCTTGTTGGACCTT-6.17
RxraMA0512.2chr5:35735226-35735240TAACCTTTAACCTC-6.22
Enhancer Sequence
CTCAAAGCAA TGTGGGTCAT AGAAAAAAGG TGGATACCAT ACACCCAGTT TTCTTGTGCA 60
CACATGCTTA AAGTTTAGGC ATTTGTTACC AGACGGAAAA AAAAGTTGAG ACAAATCGAC 120
TGGGTGGTGA CAGTGGCTTA AAGTGATTCT GCCCTAATGA GCTCTTCCGT TTCCTTCTCA 180
TTTGTTCCTA GTTTTGCTAA TTGGCATCAT TGTTTGTTAA GCTAAGTTAA CATTCATGTC 240
TGCAAAGCAT GTGTAAAAAA GCGCATGTGT TTGTGCATGT ATGTGTGGGC GAAGACCTTT 300
ACATTGTGTA ATGATGTTGA ATTTGGTTTT GGTCCAAAAT ACAGTAGATT AACTGTGTTT 360
TGGGATAGTT TCACAGGAGA AGGTATGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGCAC AGTACATCTT 420
GTATTCCTTA CATTGTGGGG ACCAAATGTC CTTACGTGTA TAGCAATACC AAATACTGTC 480
CAAAATACAG TAGATTAACT GTCCTCTGGG ATAGTTTCTC TGTAGAAGGT GTGTGTGTGT 540
TTGCGCGCAC ATCTTGTATT CCTTACATTG TGGGAACCAA ATGTCCCCAT GTGTATAGCA 600
ATACCAAATA TTGTCCAAAA ACAATACATT AACTGTACTT TTAAACTGTT TTGCTGGAGG 660
TGTGTGTGCG TGCAATACTT GTATTCCTTA CATTGTGGGG ACCAAATGTC CCTGTTTGTA 720
GCAATACCAA ATACTGTCCA AAAACAGCAG ATTAAATGTG CTTTTGGATA GTTTAGCTGA 780
AAAAGGTGTG TGTGTATGCA CCTTGTATTC ATTACATTGG TTTACCAAAT GTCCCATGTT 840
TAGCAATAGC GGTACATTTT GACCTTGTTG GACCTTTTTT GCTCCTCATG AGGAAAATGG 900
CTTATAACAT AATAATAAAG TATTTTGAAA ATGTCAAAAT GCAAATTTTT TGTGGGGGTT 960
GGGTTTCGGG GTAGGGTTGT GGTAGAGGGA CAAAATTTAC AACTTGTACA GTATAAAATT 1020
CATTACATCT ATAAGTCCTT ACAAAGATTG CTGTGTGTGT ATGTGTGTGT GTGACGAGGA 1080
GGTGGAATGA CGGTAATGGA GGAACTCAGG AGGGTGTTGA TGGAATATTC AAGCAGATAA 1140
TAGAGCAATT TCACACACAC CCCCCGTCCC AGCGCACACA CTTCACTCTC TCATTCTCTC 1200
TCACCCACAC TCAGTCAGTA GGGAATCATG AATGACAATC CAACACTGCC CCACCCAGAA 1260
AGCCCCCGAT AGGCCCTGCT CAGCACACTG AGAACACAGC ATTACAACAA AAACACTAGC 1320
ACAGACCAAA AAAAGACACA CACCTACACA TGCATAGACT GATTAGGAAA AAAAAAGACG 1380
ACAGGCAAAT CCAGACACCT ACACACACAC ATGGACCTGC GTTTCGTGTG CCAGTCCTCT 1440
AGGATGAGTG TGTGTATATC TGGGAACGCA GCCATAGGCA GATGATCTGG TTGACTCTGT 1500
GAGGAATGGA CTCAGAAAAC TTTAGTGTGT CAGTATGCGT GAATAAGTGT GTGCGTGCGT 1560
GTCTGAACCG GTAAACTTGG CGTGAAATTG TGGTGGCGAC TGTGACGGAT CTTCATTTCC 1620
ACTCTGACAG TGGTGCTCAC ACACACACAT TACTACCTTT GTTCTTATAC AACAGGTTGG 1680
AGAAAGAAAA AAAATGTGTG TGCGCAGCTG TGTGTATGTT TGTGCTTGTG TGTGTGTGTA 1740
TGTGGTTTAC GAGACAAATT TGTATAATGA CATGGGTATG ACGTTGGTAT GACAATGTTA 1800
AGGTGGTTTA TGAGGACATG CATTGTGTCC TTGTAATTCA ATTGCTTAAA AAAATCTTAA 1860
CCGGGTCTTT TGACATTCAA AATTAGGTTG AATGCAGGGG TATAATATAT AATATAAGCT 1920
TTTAAAATGC AATATATCAA TGCTGAGTCC TCGTAAACCA CATATATAAG TAAGTGTGTG 1980
TGCTGGCATG TATCAGGTAC TAAATAAAAG TCATGTTAAG TGCCTTTAAT GATTGTTTAA 2040
GAAACCCATT ATGTTCAGCA AATGGATCCC GTATTGATTT CATGTCATTG TACGAGTGTC 2100
GGTGTCTCAG GTTTGGTCAT CTTTCTTGAC TCTTAAATAA TGTATTTCTA ATGGACTCCA 2160
TGCTGCACTT ACACACTCCA TTTAAACGTG ACAGGATTCC GATCAATCAG TGATCAATAA 2220
CCTTTAACCT CTGTGCACGG GTCACTCTTA ACCACAGATA TGCATTGTGT TCTGACTCGG 2280
AGTCGGCTGG ATAGTTGTTT TATGTCCTAA CAGGGAGATT TTTGCTGCAT TGTGTCATGG 2340
CTAAATCTAC ACGCAGACCA TCATCATGGT CATTTTCTCC TCGGTTTTAG CATAATTAGC 2400
TTTATTTGTG GTCTCTTTTG AAATGCGGTG GGGAAAGAAA TC 2442