EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-38269 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:27293191-27294182 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr5:27293761-27293778TGTCCTTGACTTGACCT-6.3
RORA(var.2)MA0072.1chr5:27293511-27293525TTGACCTACTTATT-7.82
RORCMA1151.1chr5:27293512-27293524TGACCTACTTAT-7.22
Rarb(var.2)MA0858.1chr5:27293761-27293778TGTCCTTGACTTGACCT-6.24
SOX21MA0866.1chr5:27293747-27293762AATAATTGCAGTGTT+6.38
Sox11MA0869.1chr5:27293747-27293762AATAATTGCAGTGTT+7.09
Sox1MA0870.1chr5:27293711-27293726AACAATAGCTTTGTT+6.13
ZNF263MA0528.1chr5:27293624-27293645GGAGGAGGAATAGAGAGAAAA+7.15
Enhancer Sequence
CAAACAGAAG AAATGAACTC AAATAGGGTT TTGAACAGCT AAAGGATGAG TCAATTGTGG 60
GGTTAACAAT CCCTTTAATG TTTTAAACAA CTACAAACAA TCAAATTATT CGAAACTTCA 120
ACACACCATG GAAATAAATC AACGAAAGAG CAGCGTCTAT TCCGGACTCC ACATGGTTTC 180
ATAATAAGAT TTTGAAAGTG TGTGATGACT TTATAAAGAG CATTTAGTTC ATGCAGTGAA 240
TTCAAATCTT ACATCATTTG TAACGTTAAT CATGTTAAGG ATATGAATGT GCAGAGTGTG 300
AAAAGTTTTT ATTGGTTTTA TTGACCTACT TATTAACCTT TATAATGATC CAGATGTCAT 360
GCTGTTCATG CAAACGTTTC TATTCATGAC AGAAGAGACA GCTGAGCAAC AGGTCACAGC 420
AGGACAGAAA ACAGGAGGAG GAATAGAGAG AAAAGCGCCA CTTTGCAAAC ACATACGGCC 480
ATAAAATGGA CACTGCATGA CCTTTCCACT CCAACAAGCG AACAATAGCT TTGTTTGAGG 540
CATCAGGAGA AGGCACAATA ATTGCAGTGT TGTCCTTGAC TTGACCTTGT GCATTAGAGA 600
AGAAGAACAA GAATGCATTT CAGTGGGAGA GGAAATCACA CACTAAAGGA GCTGTTTATA 660
TAGAGATCAC ATTACACATT TTCATGCTGA CATCTTTGTG AAAAACACAA AAGCTGAAGA 720
AAAGGGGAAG GACTGATGAA ATGCACTTGG AAGATTATTT TGAAATTTAC CCGATGACCA 780
AGCAATGTCT ACAGGTTATT CAAAAATGGA TTCGCAAGTC ATGAATGAAA GTTGATAATA 840
CTAACAATAA TAAACAGCAA GAGAGTAAAG CGAAGGTAAG TCAAAGTTTT TTGTTTTGTG 900
TTGGCTTTCT GTATTCACCT GCAAACAGTC TGTGCAATTA TTATTATGCT ACAAGCAATA 960
TATGTCTGTT CAAATTAATT TTTGTTATTT A 991