EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-38133 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr5:23873510-23874868 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr5:23873772-23873783ATTGCACAATA+6.62
IRF1MA0050.2chr5:23874703-23874724AAAAAAAAAGAGAAAGTGAGC-7.19
IRF9MA0653.1chr5:23873534-23873549AACAAAACTGAAACA+6.1
Enhancer Sequence
AAATGATGTA GTCCTTTGAG TCCAAACAAA ACTGAAACAT TGATTTTACT GTAACAATAA 60
GCTTGATTTA TTTTGGTTCC ACAACAGAAA AATATTTTTA CAATTTTGGA TAGCTTATTC 120
TAAAACAAGG AAAATCACAT TACTAAACAT TGTTATGTAC TGTATGTTCA ATATATCTAA 180
ATGCATAAAT GATAGCATAT GACAAAAACA CTACTAACTT GGTTGTAGTT TTCACAACAT 240
TTTAATGATG CTGTATTTGC ACATTGCACA ATATAATATT AGCCAGCGCA TAACATTAAA 300
AATGGATGTA CAAAATCAAT GCATATAAGT TTTTCAGCTG CAACTCAGAA ATGGCCCATC 360
ATTCATGTCC TAAGCACAAA GTCTGTGATT AACATACCAA AGACTTTAAA CCAGGAGAGA 420
AACAGACTGT GGATCTCACT GAGTCAAGAT CAGGCCTATA AATGACTGCA GGAGGGAAGG 480
TGCTATTGAC ATTTAAGCCA TACAGCAAAC TACACACACA CACACACACT ACTGAACTTT 540
TCACTCCATA GTGTAAATAC AAGCGCCCTC ATATCCCCCT CTATAGAGTT TACGGGAAAG 600
ACAGCACCAG TGGAGAAGTG TCCAAACAAC ATGAGTTATC GCCCCGCGGA CACTCAGAGC 660
ACACGGAGAG GAGACGCTAA GCAAACACGG CCAAAAATAA AAGACAAACA GGAATAAATC 720
TAACACTGTG AAGAGGGAGC GAGTGATTTA TCGCTGTATT GGTATAGAAT TTACAGAGAG 780
AGCGAGGCGA GATGCTTCAG CGTGTTTCCC CCTGTTTAAC CCCGGCTGCT GACAGCGGTC 840
CTCCATGTCC TGTACACCTA CAAACAAAAG AGATCAAGAC CCGCTCTCAC GCCACCGGGA 900
GCCATGGCCG ACGCAGATAA CAGCGACGTC ACTCCCAGTG CATGTGTGTG TGTGTGTTTA 960
AAATGGAGGC TGAGGAGGAA CGGTTCTACG GTGCAGCTTG GCAGGCCTGA GGTTGTAGGG 1020
TGTCAAAGTG ATGTAATAAT AGTTACCAAG CGATGAAAGA AGTCTGTGTC TCATTTTCTA 1080
CATGGACCTG GAGGAAGAGA GAGAGATGGT GAGTTCGCTG TGGTGATAGA GAGAGAGGGG 1140
GGTGTATGCG AGAGTGTCGA GAGAGCAAGG GAAAAGAGGA AAGAGAGAGA GGGAAAAAAA 1200
AAGAGAAAGT GAGCCAAAAG CTCAAGATTT GACGTGGGCG TTTTTCTGAC AGCTATAATT 1260
CTCCAGCCTA CAGAATTTCA TCAACACGAG TTGTGTTAAA GCTCAGCCCG AGGGCCTCAG 1320
CCCTTTCAAG TCCCCCGCAC TGACAGGTAG ATTTATTA 1358