EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-37219 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:72114465-72115055 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr4:72114958-72114968GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr4:72114958-72114968GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr4:72114958-72114968GCTAATTAGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr4:72115018-72115031GATTATTTAATTT-6.03
Enhancer Sequence
TCAGCAGGAG TTTTCCTCTG TGTTTGGACA CTTTAAAATG AAAACAACGA ACAGAAATAA 60
AAGAAACACA CACTCAATCT GTCTCAATCA GCTCTCTAGT TCACTATTAA GTGTACTGCT 120
GAGGGAGTCA GACAAAATCA CATGAGTAGA TTAAAATAAA CTAGTAGCTC TCGAATTTTT 180
TAATAACACA TATGCGCACT ATCAGTTATA GACTTTCACT ATGTGATCTA TAATGTTCTG 240
TGTTAGTTCT CCAGGAAGAC ACTCGCAGTT GGTCAGTAAA AGTCTCTCAA CATTTCTGTT 300
GTTTTTGTTT AACACTATTC TAATCAGCAG CTTTGACAGA ATTAATCATT TTAAACGATT 360
TAATTGACTC GGAGTTTTGT AAATCTCCCT TTTCCCTCAT CTCCACTCGC CAGTGACTGA 420
GTTCATGTTT ACTAAACAGA GTCACGATAC AGAAATGAGA CGCGCCTGTT CTGCTGCTCA 480
CCTGTACGCT TGAGCTAATT AGTTATGATT AAAGTCTTTG TCAGATAACA GATTACACGC 540
GAGACTTCCT GACGATTATT TAATTTGGCA TCGCTTATAA AACAACAACG 590