EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-37175 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:70988658-70989370 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:70988836-70988853TGATTTAATTAATCAGT+6.36
CTCFMA0139.1chr4:70988902-70988921CCGCCACCAGGTGGCACTT+7.06
LMX1BMA0703.2chr4:70988837-70988848GATTTAATTAA+6.02
Enhancer Sequence
GTGTGAACGC CATACAAAAT GGCGTAGAAT AGTGCATAAG TATGCGATTC GGGACGCAGC 60
TTTAGTTTGT TGAGTTGTGG ATTAGTGGTG GGACAAAATA TATGCCCATT TATAGTGTTA 120
TTTCTCACCG CGATACATAC TCAGGCGCCA AGATATTTAC CTAAATTTAC AAAAGATCTG 180
ATTTAATTAA TCAGTTTTCC ACACTGACTT CAGCAGATAA CCGCTTTAGC CACAGTACAC 240
CCAGCCGCCA CCAGGTGGCA CTTCCCGTAA TGGCGAATCA TTAGACCTAC ACCAGCGTCA 300
TGTAAATCAC TGAGATGAGC CATTGCAATG GTGAAATTCT CAGGCATACA TACACTTTCT 360
TCTGTCCAAG CTGGGCCAAC GTATTTGTGT GTTTCAGACA TCCAGCTCCC CCGAATTTGC 420
CACTAGTTTC TTTCTAACAG ACGCGCTTTC ACTTCGCTAT ATCGCTCGCG CGTGCCCGCG 480
GCCAGTGCAA CTTCTTATGT GCTCAAACTT TTTAACTCCG CCAAAATATA TAAAGATATC 540
AATAGGACAT GAACATTTAA TTAAAAGGGC CCTGCGTTTA TTTGACTCTT ACAGACCTTG 600
TCAAAGTATT GTAGATGGTA TTTTGGCAAA AAAAATATCA GGAGAATTAA AAAACTTAGT 660
AGCCTAAATA ACTAATGTTC TCCACTGCTG AAAACATACG TGCTTATGGA GT 712