EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-37129 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:69546315-69546949 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr4:69546590-69546607TGACCCTTATGTTACCT-6.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr4:69546590-69546607TGACCCTTATGTTACCT-6.26
ZIC1MA0696.1chr4:69546532-69546546AACAGCAGGGGGTA-6.24
Enhancer Sequence
CCTTAGAGAC TGCTGAGAAT TGCTCCAAGG GACCAGGGGC GGACTGTAAG GATCCAAAAT 60
ATCACACCAT AAGAACTGTG ATGGAATTTC ATGAGACAAG ATGCAATGTT CCAATGGATT 120
TTCTAATCTG AGAAGTGATG AAGAAACCAA CTGTTCCACT GTTCTATTCA AATCACTGTT 180
GACAATGCAA TCACAGGCTG GAGAAACAGA GCTACTCAAC AGCAGGGGGT AATGCGAAGA 240
AGTCACCCTT CTCCTTCCAC TTAAACCCCC CTTCTTGACC CTTATGTTAC CTTCTGATTA 300
GAGCACATTT CACATAAAAT GTTCAAGGTT TTAATAGGGT GTATCTTGCA TCACTATATT 360
CATGTTTGGT ATCATTTTAA ATGTCTCTGT GTGCTTGGTA AAGTGGTCTT AATTTTACAG 420
TAATATTTTA CTGGTATATG TTGATTTGGT TTTTGACTTC TATAAGATCT TGATAAGATG 480
CTCTCCCTCC TAAGAGATGA TTAAGTCCTC AAATTGACCA GGTCAGGGTT TCTGTGGCTG 540
TTTGTTTTGA CTTGAGTATA TAAGGTAAGA TGTGCTTTAG GACGGGGGGA GATCTTGTAA 600
AAAGACACCC CATTGCAGCA TCTCTGAGAC TTAT 634