EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-36985 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:65798009-65798857 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:65798783-65798795GTTTGTTTGTTT+6.32
HNF4A(var.2)MA1494.1chr4:65798105-65798120TTGAACTTTGAACTT-6.23
HNF4GMA0484.1chr4:65798106-65798121TGAACTTTGAACTTT-7.73
Hnf4aMA0114.3chr4:65798104-65798120ATTGAACTTTGAACTT-6.76
ONECUT1MA0679.1chr4:65798807-65798821AATATTGATTTTAT-6.3
ONECUT2MA0756.1chr4:65798807-65798821AATATTGATTTTAT-6.18
ONECUT3MA0757.1chr4:65798807-65798821AATATTGATTTTAT-6.37
RXRBMA0855.1chr4:65798106-65798120TGAACTTTGAACTT-6.32
RXRGMA0856.1chr4:65798106-65798120TGAACTTTGAACTT-6.54
RxraMA0512.2chr4:65798106-65798120TGAACTTTGAACTT-6.4
Enhancer Sequence
TTTGCTTTTT TTATTGTGGC TTTTTCTAAA ACATTTTTTC CCAGTGCAAG TTAAAATCAA 60
GTTCTGTATT TCGGCTGTTT AAGGTCTCAC TTTGCATTGA ACTTTGAACT TTTTACATTC 120
AGAGATGTTG TTTATGTTCA CACAGCTAAA TTACCCATCA ACTAAAGTTT AAAATATGAT 180
ATTGTAGTTG ACCACCCATT TAACTATAAA ATGCAGCAGC CAAAATAAAA AAGCTTCCAT 240
CAAAAGTCAA CTTATTTCCC AATACATCTT TATTTCTCTT TAAAGCTATG GTTCGTATAG 300
CTGCTAAACT TCCCATCAGT ATCAGTAATG TGTTTTGAGT CTTCACTGTT CTCCACTGCT 360
CATTTGCATC TTTATACCAG CATTAATGGG GGCCAATTGA GTATTAACCA ATCACATGCC 420
AGATCAAGTA GGTCAGCAGG GTTGTATCTA TATATTCTGC GTTCTTAACA GAAACTTCAT 480
TGGCTTATTT AGCTATAAGA GAACAACTTT GGAGGACAAA CTACGATTGT TGGTTCCTAC 540
ATTGAGATTA TTACCAACAA CAACATACAA AGAAAAACCG ACTGAGGCCA TTTCTCATCC 600
CACTTCTTCA TTGAAGACTG GAAAGGTGAG TTGCACATTC TGAATTTACA CTCAAATAAT 660
ATCTGAATGC TAACATTATA AAATGTAAAA TCTAAACATG TGCATGCATT GTTCAACAGT 720
GTATTAAGTT TTTCAGTCAT TTTTAAAAGC TTTTTTACAA CTATTTAGTT ATGTGTTTGT 780
TTGTTTGGTT TGGTTATAAA TATTGATTTT ATCCTGACAA ATGGACTGTA GCCCAAATAA 840
GTTTCAAC 848