EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-36894 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:63499268-63500238 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:63499857-63499878CTCTGCTTTCACTTTCGATTT+8.54
IRF2MA0051.1chr4:63499856-63499874GCTCTGCTTTCACTTTCG-7.26
IRF3MA1418.1chr4:63499860-63499881TGCTTTCACTTTCGATTTCCT-6.51
IRF7MA0772.1chr4:63499861-63499875GCTTTCACTTTCGA-6.27
IRF9MA0653.1chr4:63499861-63499876GCTTTCACTTTCGAT-6.15
Enhancer Sequence
GTTAGTTAGT ATTGAAACGT TACCAGCAGG CCCGGCTCCA ACCAATATAG AGGTAAAGTT 60
GGTTTTATAT TCTGATATTC AGACATTCCC CTTAATAATA TCATTTCAGA AAAGTATTCA 120
TTGCAAATTC TAAATAGGGA AATCATAATA GCAGCCAATG ACTATCAAAG TACAACATGT 180
TCAAAGTCAA ATAAACAGTG TTAATGCTGT TTTCAAGTCA TACTTGCATG CTAATTCCAA 240
TCGAATATTT AAAGTAACAT GGTAAACAAT ATATAGACTG CTAAATGAAC GAATGTGTAA 300
ATATAAAACC AACTTTACCT CTATCCAACC AATTTGGCGC CCTAGGCAAG ATTTCAGGTG 360
GCATCCCTTC ACATAGCAGT AAATTCCACT GCTAGTGTAC ATACAGTCAT AAGAAACTAA 420
ATAGCTTTTT GATCGACTAC TGCAAGCTGG GAAAACATCA GATAAATATG CCAATGCAAT 480
TAACAAAATT GCTGAACAGA TCTAATATTT ACACATTTGC TTGAGGAAGA AATGATGGGG 540
ACTGTTATTG CAGTTTAAGG ATCATCCGCA CTCTTCCGGT TAACGAAAGC TCTGCTTTCA 600
CTTTCGATTT CCTGACTGTT TTAAGTTTAT TTTGTGCTAA ATGATGTGAA ATTTTCGAGT 660
CAACCTGATA CAGAAGAGCA CAAACACTTT TAAGAGATAG AAAATAACCC ATTATATTGT 720
TCAAATGACC ATGTTTGGAC TGTGTTTAAT CGGTGTTTTA GGCTTTGAGC TTCAAGAGCA 780
GACAGTGCTA AAAATCACGC TTATACACAT ATAAACCCAT TTATCATCTT CACAAATCAG 840
CGTAATGTAG AAGTGTTAAA CTCACATGCA GAAGTACAGA TGCTCTTTTG CAGCAGGAAC 900
ACGATGTGAG CTCTTTGACG CTTTCGGTTT GTCAACTTCT TCAGTATTTT GGCGGTTGTC 960
AAACTATAAT 970